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今天为大家带来第四份礼！总结了微生物的一些耐药机制，研究方法以及相关的生物信息软件，相信会让你对微生物耐药机制有个好的了解。

抗生素是20世纪最重要的医学突破之一，使人类免受多种病原菌的侵害。但与此同时，由于抗生素的不合理使用，细菌对抗生素的耐受性越来越强，同时耐药性出现大规模传播，超级细菌不断涌现。如果全球不采取措施遏制抗药性超级细菌的扩散，到2050年每年丧生的人数可能将增加1000万人。

1. 耐药基因数据库介绍系列1

主要介绍一些微生物耐药机制中经常使用的耐药数据库

2. Nucleic Acids Research| oriTfinder: 细菌耐药质粒接合转移研究工具

主要介绍：接合质粒和整合性接合元件(Integrative and conjugative element, ICE)在线分析工具 oriTfinder，接合性质粒和ICE的接合转移区通常由四个模块组成：转移起点（oriT）区，松弛酶 (relaxase)，IV型伴侣蛋白 (type IV coupling proteins, T4CP)和细菌IV型分泌系统(type IV secretion system, T4SS)。

3. Nature Microbiology | 耐药性分析软件：NanoOK RT package 简介

主要介绍：NanoOKRT是一种使用Nanopore测序数据实时进行菌种分类和抗生素抗性鉴定的工具。

4. Science l 对多种耐药真菌有效的新天然产物的研究

主要介绍如何开发和研究天然抗真菌药物

5. Virulence |第三代头孢菌素耐药肺炎克雷伯菌获得性耐药研究

主要介绍第三代头孢菌素抗性肺炎克雷伯菌超强毒（ST23 MDR- hvKP）临床菌株（RJA166）的遗传背景和微生物学特征。属于K1血清型的ST23 hvKP菌株携带的具有blaDHA-1基因的天然质粒可转移至hvKP和cKP，可能是肺炎克雷伯菌和其他病原体之间耐药性快速传播的原因

6. Nature reviews microbiology | 肺炎克雷伯菌的群体基因组学研究

主要介绍：基因组学方法如何提高对肺炎克雷伯菌分类学，生态学和进化的理解，以及致病性和抗菌素耐药性的临床相关决定因素的多样性和分布。

7. Nat Microbiol|噬菌体可使耐药细菌恢复对抗生素的敏感性

主要是对耐药机制的介绍：常见的细菌耐药机制包括药物的主动外排、细胞膜膜通透性降低、形成生物膜、药物作用靶位点改变、产生灭活酶等以及噬菌体是能侵染并裂解杀死细菌的病毒。

8. 文献解读｜JHM：破译一个连通的湖泊-河流-水库系统中抗生素抗性基因及其非生物指示者

主要介绍：在一个连通的湖泊—河流—水库系统中破译抗生素抗性基因（ARG）的模式以及关键非生物指标与ARG的联系。

9. 综述｜Nature Reviews Genetics：基于测序数据研究抗菌素抗性的方法和资源

主要介绍：含从传统的抗生素敏感性测试到最新的深度学习方法，详细介绍了抗菌素耐药性的鉴定和表征方法，于基于测序的耐药性发现，并讨论了用于抗菌素耐药性研究的工具和数据库

10. 综述｜Water Research: 环境中抗生素抗性基因的溯源追踪--挑战、进展和展望

主要介绍：讨论有关环境ARG污染溯源追踪研究中的挑战和进展，并且会特别关注近期宏基因组学的方法进展。提出了一个基于宏基因组学的综合框架，在该框架中结合了实验设计和宏基因组学分析，将有助于实现在ARG污染换几个闹钟功能中进行可靠的溯源追踪。

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