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火鸡即吐绶鸡(turkey)。鸡形目——吐绶鸡科——吐绶鸡属的一种;是一种重要的农业物种,对世界家禽肉制品生产的贡献居第二位。
火鸡基因组2010年发表在PLoS Biology,应用Roche 454和illumina技术相结合测序组装出火鸡的基因组草图,Contig N50 为12.6kb,Scaffold N50 为1.5Mb,而遗传图谱的构建不仅可用于QTL定位分析,还可作为框架使测序所得scaffold组装成染色体。同时遗传图谱的构建还能反应火鸡的重组热点,反应出火鸡在染色体水平上的重组和交换关系;而且通过比较基因组学的分析,例如和鸡基因组基因组比较分析,研究基因组进化机制及有助于鉴定基因组重组、复制、缺失等不常发生的基因组事件。
Aslam等(BMC genomics,2010)通过对18个近亲家系1008(35F1和973F2)只火鸡群体, 应用775个SNPs进行分型,其中570个SNPs构建了火鸡的遗传图谱,总的遗传图距为2,234c M,覆盖了28个连锁群。此连锁图谱比先前报道应用SSR等标记的图谱高,具有更均匀的标记(markers)分布,并且本图基于SNP标记,比先前连锁图中所用微卫星标记相比,SNP标记可更方便和快捷地用于基因分型分析。本研究显示火鸡和家鸡仅含有相当少数目的染色体间和体内的基因组重组而具有高度保守的基因组结构。
Aslam et al.: A SNP based linkage map of the turkey genome reveals multiple intrachromosomal rearrangements between the Turkey and Chicken genomes. BMC Genomics 2010 11:647.
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GMT+8, 2024-5-16 04:03
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