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科学网 群组 农学 植物基因组
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[原创] 植物基因组

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发表于 2017-5-19 21:36 |显示全部帖子

禾本科(Gramineae):                                                   

Oryza sativa L(稻):

1、subsp. indica(籼稻):ensemblRAGWRISNCBI(Oryza sativa subsp. indica)

2、 subsp. japonica(粳稻):MSURAPNCBI(Oryza sativa )、ensembl国家水稻数据中心IC4RJGIGRM

Zea maysL(玉蜀黍、玉米):maizegdbTIGRensemblJGI

Triticum aestivum L(普通小麦):NCBIensembl

Sorghum bicolor (L.) Moench(高粱):NCBIensemblJGI

Saccharum officinarum L(甘蔗):NCBI

Leguminosae(豆科):

Arachis hypogaea L(落花生,花生,地豆):NCBIpeanutbase

Vigna radiata(Linn.) Wilczek(绿豆):NCBI

Vigna angularis(Willd.) Ohwi et Ohashi(赤豆):NCBI

Vigna unguiculata (Linn.) Walp(豇豆):NCBI

Phaseolus vulgaris Linn(菜豆,四季豆):NCBIJGI

Vicia faba L( 蚕豆, 南豆,胡豆,竖豆、佛豆):NCBI

Glycine max (Linn.) Merr(大豆,黄豆):NCBIensemblJGIsoybase

Cruciferae(十字花科):

Arabidopsis thaliana (L.) Heynh(鼠耳芥,拟南芥菜):NCBITAIRensemblJGI

Brassica napus L(欧洲油菜):NCBIensemblgenoscope

Brassica rapa L (芜青):NCBIensemblJGIBRADbolbase

Brassica oleracea L(甘蓝):NCBIensemblBRADbolbase

Raphanus sativus L(萝卜):NCBI

Brassica juncea(L.) Czern. et Coss(芥菜):NCBI

Brassica parachinensis L. H. Bailey(菜苔):

Brassica pekinensis (Lour.) Rupr(白菜):

Brassica chinensis L(青菜):

Solanaceae(茄科):

Solanum melongena L(茄,矮瓜;吊菜子,落苏):NCBISGN

Lycopersicon esculentum Mill(Solanum lycopersicum,番茄):NCBIensemblJGISGN

Solanum nigrum L(龙葵,野海椒,灯龙草,白花菜,地泡子):NCBI

Solanum tuberosum L(阳芋,土豆):NCBIensemblJGISGN

Capsicum annuumL(辣椒):NCBI

Capsicum frutescens L(小米辣):NCBI

Nicotiana tabacumL(烟草):NCBISGN

Lycium barbarum L(宁夏枸杞):NCBI

Datura stramoniumLinn(曼陀罗):NCBI

Cucurbitaceae(葫芦科):

Benincasa hispida (Thunb.) Cogn(冬瓜):NCBI

Cucumis sativus L(黄瓜):NCBIJGI

Momordica charantia L(苦瓜,凉瓜,癞葡萄):NCBI

Cucurbita moschata (Duch. ex Lam.) Duch. ex Poiret(南瓜):NCBI

Cucumis melo L( 甜瓜,香瓜,哈密瓜,白兰瓜,华莱士瓜):NCBIMELONOMICS

Citrullus lanatus(Thunb.) Matsum. et Nakai(西瓜):NCBIICuGI

Cucurbita pepo L(西葫芦):NCBI

Vitaceae(葡萄科):

Vitis vinifera L(葡萄):NCBIensemblJGI

Malvaceae(锦葵科):

Gossypium arboreum(树棉,亚洲棉,中棉、木本棉,A组基因):NCBIcottongen

Gossypium barbadense(海岛棉,光籽棉,木棉):NCBIcottongen

Gossypium herbaceum(草棉,阿拉伯棉,小棉):NCBIcottongen

Gossypium hirsutum陆地棉,高地棉,大陆棉,美洲棉):NCBIcottongen

Gossypium raimondii(雷蒙德氏棉):NCBIcottongenJGI

Rosaceae(蔷薇科):

Pyrus pashia(川梨):NCBIGDR

Rosa rugosa Thunb(玫瑰):NCBIGDR

Malus pumila Mill(Malus domestica,苹果):NCBIGDRJGI

Fragaria × ananassa Duch(草莓):NCBIGDR

Eriobotrya japonica (Thunb.) Lindl(枇杷):NCBI

Rutaceae(芸香科):

Citrus reticulata Blanco(柑橘):NCBI

Citrus sinensis (L.) Osbeck(甜橙):NCBICsiDBJGI

Citrus limon(L.) Burm. f(柠檬):NCBI

Citrus maxima(柚子,参考Citrus clementina):NCBIJGI

其他:

Sinbase(芝麻):Sinbase

Populus trichocarpa(杨树,三叶杨,欧洲大叶杨):NCBIensemblJGI

Physcomitrella patens(小立碗藓):NCBIensemblJGI

Chlamydomonas reinhardtii(莱茵衣藻):NCBIensemblJGI

Carica papaya(番木瓜):NCBIJGI

Phaeodactylum tricornutum(三角褐指藻):NCBI

Brachypodium distachyon(二穗短柄草):NCBIensemblJGI

Ectocarpus(褐藻):NCBI

OneKPplantgdb

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发表于 2017-5-20 09:40 |显示全部帖子
不错  尤其是那些研究小作物的有时都不好找
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