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[原创] 植物基因组

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发表于 2017-5-19 21:36:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
禾本科(Gramineae):                                                   
Oryza sativa L(稻):
1、subsp. indica(籼稻):ensemblRAGWRISNCBI(Oryza sativa subsp. indica)
2、 subsp. japonica(粳稻):MSURAPNCBI(Oryza sativa )、ensembl国家水稻数据中心IC4RJGIGRM
Zea maysL(玉蜀黍、玉米):maizegdbTIGRensemblJGI
Triticum aestivum L(普通小麦):NCBIensembl
Sorghum bicolor (L.) Moench(高粱):NCBIensemblJGI
Saccharum officinarum L(甘蔗):NCBI
Leguminosae(豆科):
Arachis hypogaea L(落花生,花生,地豆):NCBIpeanutbase
Vigna radiata(Linn.) Wilczek(绿豆):NCBI
Vigna angularis(Willd.) Ohwi et Ohashi(赤豆):NCBI
Vigna unguiculata (Linn.) Walp(豇豆):NCBI
Phaseolus vulgaris Linn(菜豆,四季豆):NCBIJGI
Vicia faba L( 蚕豆, 南豆,胡豆,竖豆、佛豆):NCBI
Glycine max (Linn.) Merr(大豆,黄豆):NCBIensemblJGIsoybase
Cruciferae(十字花科):
Arabidopsis thaliana (L.) Heynh(鼠耳芥,拟南芥菜):NCBITAIRensemblJGI
Brassica napus L(欧洲油菜):NCBIensemblgenoscope
Brassica rapa L (芜青):NCBIensemblJGIBRADbolbase
Brassica oleracea L(甘蓝):NCBIensemblBRADbolbase
Raphanus sativus L(萝卜):NCBI
Brassica parachinensis L. H. Bailey(菜苔):
Brassica pekinensis (Lour.) Rupr(白菜):
Brassica chinensis L(青菜):
Solanaceae(茄科):
Solanum melongena L(茄,矮瓜;吊菜子,落苏):NCBISGN
Lycopersicon esculentum Mill(Solanum lycopersicum,番茄):NCBIensemblJGISGN
Solanum nigrum L(龙葵,野海椒,灯龙草,白花菜,地泡子):NCBI
Solanum tuberosum L(阳芋,土豆):NCBIensemblJGISGN
Capsicum annuumL(辣椒):NCBI
Capsicum frutescens L(小米辣):NCBI
Nicotiana tabacumL(烟草):NCBISGN
Lycium barbarum L(宁夏枸杞):NCBI
Datura stramoniumLinn(曼陀罗):NCBI
Cucurbitaceae(葫芦科):
Benincasa hispida (Thunb.) Cogn(冬瓜):NCBI
Cucumis sativus L(黄瓜):NCBIJGI
Momordica charantia L(苦瓜,凉瓜,癞葡萄):NCBI
Cucurbita moschata (Duch. ex Lam.) Duch. ex Poiret(南瓜):NCBI
Cucumis melo L( 甜瓜,香瓜,哈密瓜,白兰瓜,华莱士瓜):NCBIMELONOMICS
Citrullus lanatus(Thunb.) Matsum. et Nakai(西瓜):NCBIICuGI
Cucurbita pepo L(西葫芦):NCBI
Vitaceae(葡萄科):
Vitis vinifera L(葡萄):NCBIensemblJGI
Malvaceae(锦葵科):
Gossypium arboreum(树棉,亚洲棉,中棉、木本棉,A组基因):NCBIcottongen
Gossypium barbadense(海岛棉,光籽棉,木棉):NCBIcottongen
Gossypium herbaceum(草棉,阿拉伯棉,小棉):NCBIcottongen
Gossypium hirsutum陆地棉,高地棉,大陆棉,美洲棉):NCBIcottongen
Gossypium raimondii(雷蒙德氏棉):NCBIcottongenJGI
Rosaceae(蔷薇科):
Pyrus pashia(川梨):NCBIGDR
Rosa rugosa Thunb(玫瑰):NCBIGDR
Malus pumila Mill(Malus domestica,苹果):NCBIGDRJGI
Fragaria × ananassa Duch(草莓):NCBIGDR
Rutaceae(芸香科):
Citrus reticulata Blanco(柑橘):NCBI
Citrus sinensis (L.) Osbeck(甜橙):NCBICsiDBJGI
Citrus limon(L.) Burm. f(柠檬):NCBI
Citrus maxima(柚子,参考Citrus clementina):NCBIJGI
其他:
Sinbase(芝麻):Sinbase
Populus trichocarpa(杨树,三叶杨,欧洲大叶杨):NCBIensemblJGI
Physcomitrella patens(小立碗藓):NCBIensemblJGI
Chlamydomonas reinhardtii(莱茵衣藻):NCBIensemblJGI
Carica papaya(番木瓜):NCBIJGI
Phaeodactylum tricornutum(三角褐指藻):NCBI
Brachypodium distachyon(二穗短柄草):NCBIensemblJGI
Ectocarpus(褐藻):NCBI
OneKPplantgdb
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发表于 2017-5-20 09:40:03 | 显示全部楼层
不错  尤其是那些研究小作物的有时都不好找
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