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  • 宾夕法尼亚大学,博士后

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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sam文件小知识:正负链reads在sam文件中的序列信息 2020-03-10
Sam文件的第二列: FLAG:0正链,16负链,4没比对上 如果一个read mapping到正链上,sam文件第十列所展示的是这个read的序列。而如果一个read mapping到负 ...
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0_based and 1_based (Sam file, Bam file and Bed file) 2019-04-11
0_based numbering: the initial element of a sequence is assigned the index 0; 1_based numbering: the initial element of a sequence is assigned t ...
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Ensembl/Gencode数据库中基因注释统计 2018-12-18
现在基因组非编码区域的注释条数越来越多,那么究竟注释了多少非编码基因,多少假基因呢? 这里仅以Gencode数据库中人类和老鼠的最新注释为例。在老鼠的注释信 ...
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利用liftOver进行不同版本的坐标转换 2018-12-15
Here I want to show how to convert coordinates from mm10 to mm9 based on command line.  And you also can do this using the web interface at htt ...
(1957)次阅读|(0)个评论
[转载]CDS, Exon, intron, utr的定义 2018-12-15
参考连接: ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/embl/doc/FT_current.html CDS: coding sequence; sequence of nucleotides&nb ...
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虚拟机Ubuntu中添加硬盘 2018-12-13
最近换了新电脑,所以重新安装了虚拟机。我用的是Oracle的虚拟机。在里面安装了ubuntu18.10 1 通过设置添加新的硬盘 2 进入ubuntu系统检查硬盘情况 命 ...
(1580)次阅读|(0)个评论
上传NGS数据到GEO 2018-12-04
以下信息都是基于个人最近一年的经验。GEO网站可能会更新,具体信息可以登录GEO官网查看。 上传数据官网: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/sub ...
(3515)次阅读|(1)个评论

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GMT+8, 2020-10-25 23:12

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