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- perl解决gene id与ensembl gene id以及geneid 与refseq id的转换
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- 我们在处理基因数据时候常常会遇到一些id转换的困难，虽然有很多id转换的工具，比如ENSEMBL的biomart，但是总的说来都不是很完美，最终觉得还是不如自己编写程序来匹配用得方便（因为自己写一些perl程序来作匹配可以更好的满足自己的特殊需求），但是我们又苦于去寻找这些id2id的文件，下面我主要以介绍GENE_ID转换为ENSEM ...
- perl提取fasta格式文件中的DNA序列
- Bioperl用来处理一些学问题很方便，最近在用Bio::SeqIO处理fasta格式的文件，有了需要注意的几个地方，首先我们来一段程序看看： 这是我本地的fasta格式的文件（从genbank上面下载的） 然后代码如下： #!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use Bio::SeqIO; #该perl模块的详细 ...
