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应用PAUP 4.0 软件分析0-1二元数据教程

已有 4076 次阅读 2018-12-28 09:55 |系统分类:科研笔记

应用PAUP 4.0 软件分析0-1二元数据教程

By Wu Weifeng

 

1. 准备nexus格式文件(下文指001.nexus);

2. 打开PAUP软件,file - import data载入001.nexus

3. Execute执行001.nexus

4. File -log output to file创建日志记录;

5. Analysis - distance settings- RFLP/AFLP distances - Nei-lisites)其它默认,ok

6. Trees - generate trees -NJ/UPGMA,生成聚类树;

7. Analysis - bootstrap/ jackknife analysis- number of replicates:1000-continue,完成自举检验,生成分支具有自举值得聚类树。



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