新冠病毒株的变异与地域分布

诸平

FIGURE 1 | (A) Distribution of SARS-CoV-2 clades in the World at the time of writing (26 June 2020). (B) Stacked area chart of relative SARS-CoV-2 clade frequency (y-axis) over time (x-axis) worldwide. (C) Stacked area charts of relative SARS-CoV-2 clade frequency over time in six continents

意大利博洛尼亚大学（University of Bologna, Italy）的研究人员分析了48635个冠状病毒SARS-CoV-2基因组(见表1)，这些基因组是由世界各地实验室的研究人员分离出来的。此项研究于2020年7月22日在《微生物学前沿》（Front. Microbiol.）杂志网站上发表——Daniele Mercatelli，Federico M. Giorgi. Geographic and Genomic Distribution of SARS-CoV-2 Mutations. Front. Microbiol., 22 July 2020 | https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01800。作者是来自博洛尼亚大学药学和生物技术系（Department of Pharmacy and Biotechnology）的两位科学家。

对SARS-CoV-2测序进行的最广泛研究结果显示，导致COVID-19大流行的病毒SARS-CoV-2至少呈现6种病毒株，即G株、GR株、GH株、L株、S株和V株。尽管如此，SARS-CoV-2突变率仍然很低。在欧洲和意大利，传播最广泛的是G菌株，而在武汉传播的是L菌株，不过L株正在逐渐消失。不管怎样，新冠病毒株的一些突变，不会对于开发有效疫苗带来影响。是因为尽管有突变，该病毒几乎没有变异性，这对于研究可行疫苗的研究人员来说无疑是个好消息。

SARS-CoV-2六大病毒株的特征突变的现行定义见表1所示。

TABLE 1 | Current definition of characterizing mutations of SARS-CoV-2 phylogenetic categorization systems (GISAID clades and PANGOLIN lineages).

这样一来，研究人员便可以在病毒传播到各个大陆的过程中，绘制出病毒的扩散情况和突变情况。最初结果是令人鼓舞的。冠状病毒几乎没有变异，每个样品大约有7个突变，与普通流感的变异率相比，则是两倍以上。

意大利博洛尼亚大学（Unibo）研究人员，研究协调人费德里科·乔治（Federico Giorgi）解释说：“大概已经对SARS-CoV-2冠状病毒进行了优化以影响人类，这说明了它的进化变化程度很低。” “这意味着我们正在开发的治疗方法，包括疫苗，可能对所有病毒株都是有效的。”

目前，有6种冠状病毒。最初是2019年年底在武汉疫情中发现的L株，它的第一个突变-S株-出现在2020年初，而自2020年1月中旬以来，又发现了V株和G株。迄今为止，G株流行最为广泛：在2020年2月底，G株突变为GR株和GH株。

费德里科·乔治说：“ G株及其相关的GR株和GH株是迄今为止分布最广的菌株，占我们分析的所有基因序列的74％。” “它们具有4个突变，其中2个能够改变病毒的RNA聚合酶和Spike蛋白的序列。这一特征可能促进了病毒的传播。”

如果我们看冠状病毒图谱（See FIGURE 1），不难发现G株和GR株是欧洲和意大利疫情中最常见的菌株。根据现有数据，GH株在意大利疫情中似乎几乎不存在，而在法国和德国新冠疫情中则更为常见。这似乎证实了最近几个月的围堵方法是有效的。

在北美，最普遍的菌株是GH株，而在南美，研究者发现GR株则更为常见（See FIGURE 1）。在亚洲，武汉新冠疫情中发现了L株，而G株、GH株和GR株的传播正在增加。这些毒株仅在3月初才在亚洲传播，距它们在欧洲传播已超过一个月之久。

在全球范围内（See FIGURE 1），G株，GH株和GR株在不断增加。S株可在美国和西班牙的某些区域找到，而L株和V株在逐渐消失。

除了这6种主要的冠状病毒株外，研究人员还发现了一些不常见的突变，尽管有突变，但目前并不令人担忧，不过仍应进行监测为宜。

费德里科·乔治证实：“罕见的基因组突变少于所有测序基因组的1％。” “但是，对它们进行研究和分析是至关重要的，这样我们才能确定其功能并监测其传播。所有国家都应通过提供有关病毒基因组序列的数据来为这一事业做出贡献。”