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透明与公正的审稿制度
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《欧洲分子生物学学会会刊》（The EMBO Journal）是分子生物学领域的重要学术杂志。该刊自1980年代创办后，逐渐发展成为与《美国科学院院报》（PNAS）基本上等量齐观的优秀刊物，其影响因子曾长期高于PNAS。该刊与《细胞》（Cell）一样只发表长篇论文，在许多欧洲科学家的心目中，EMBO J俨然就是欧洲的Cell。
由于近年各杂志抢夺高水平论文的竞争愈演愈烈，以自然子刊、细胞子刊为代表的一批商业性学术出版物对许多水平仅次于CNS的严肃刊物造成很大冲击，再加上各杂志本身的弱点，很多原本极受科学家青睐的杂志近几年都出现水平下降的趋势。EMBO J和J Cell Biol就是其中的典型例子。为了遏制此趋势，各杂志都从自身找原因，并祭出不同的救亡措施，力求保住自己的学术水平和地位。可以说，这也是一种良性竞争，对学术发展未必是坏事。
在此背景下，已转由自然集团出版的EMBO J从前两年开始推出一项新政，就是将本刊所发表论文的基本数据及分析公开。从2009年开始，对于所有接受发表的论文，都在附件中全部公开编辑部意见、审稿意见和作者对审稿意见的回应。编者推出此项新政的立意，是使审稿过程更加透明和公正。读者阅读论文时，只要点击文末的RPF (Review Process File, 审稿处理文件)，就可对论文的全部审稿过程一目了然。
且不论这些措施是否能使该杂志论文的水平止跌回升，从公布的数据和分析中我们还是可以了解很多重要的信息。首先，就是这份2007和2008年影响因子只有8.662和8.295的杂志，其拒稿率还是很高的。2007年，3185篇来稿中74%未经同行外审，就由执行主编或职业编辑团队所退稿，其中只有10%征询过编委科学家的意见。送出外审的论文还有61%被无条件拒稿，其余则退修。退修稿中还有3%在修回后被拒。最终接受率只有10%。2008年的情况也基本类似，接受率也是10%。第二，就是稿件处理周期很快，未审先拒的平均4天就已决定，经过外审的平均31天有决定。最后，就是被拒稿的论文84%都在其他杂志登出，其中大部分都在经过修改后被影响因子较低的JBC、MCB、MoBC等杂志所吸纳。可见，要在这份目前已不算特别优秀的EMBO J杂志登一篇论文，还是很不容易的。
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