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无法将grub-efi-amd64-signed软件包安装到/target中的问题解决 2018-01-16
UEFI引导模式的ubuntu安装时报错“无法将grub-efi-amd64-signed软件包安装到/target中“的问题是一个bug。解决方式很简单,在安装时联网,勾选“安装时下载更新 ...
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宏基因组分析(2):拼接及评价(SPAdes+QUAST) 2017-11-16
2.1 拼接 工具: SPAdes 网址: http://cab.spbu.ru/software/spades/ 引用: Bankevich A., Nurk S., Antipov D., GurevichA., Dvorkin M., ...
(7203)次阅读|(0)个评论
宏基因组分析流程(1):质控 2017-11-16
宏基因组分析的第一步是质量控制,主要包括adapter 和低质量序列的修剪与去除。 工具: Trimmomatic 网址: http://www.usadellab.org/cms/index.php ...
(5194)次阅读|(0)个评论
基因预测工具:Prodigal 2017-11-16
1 简介 p rodigal(Prokaryotic Dynamic Programming Genefinding Algorithm)用于原核微生物基因组和宏基因组的基因预测, 是 Oak Ridge National Laboratory ...
(8328)次阅读|(0)个评论
序列多重比对工具:MUSCLE 2017-08-15
Muscle MUSCLE是RC Edgar开发的序列多重比对(Multiple Sequence Alignment,MSA)工具 下载和相关说明地址为http://www.drive5.com/muscle/manual/ 1、 ...
(8649)次阅读|(0)个评论
基因预测工具:Glimmer 2017-08-09
glimmer(Gene Locator and Interpolated Markov ModelER) 1.1简介 Glimmer是用于寻找微生物DNA,特别是细菌、古菌和病毒中的基因。其采用的方法为内插马尔 ...
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CheckM评估基因组完整度 2017-08-01
CheckM 1、简介 checkM是用于评估分离出的微生物、单细胞和宏基因组的质量工具。其使用有谱系世系关系的特有和独有基因数据集来大致估计基因组的完整度和污染 ...
(7311)次阅读|(0)个评论
R汇总: 随机分布生成函数 2016-03-07
1 、均匀分布 runif   2 、正态分布 rnorm   3 、指数分布 rexp   4 、 F 分布 r f   5 、 ...
(3214)次阅读|(0)个评论

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