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如何挖掘基因测序数据的价值
热度 1 张栋 2016-6-11 09:02
近年来,随着测序技术的不断升级,测序通量越来越高,同时测序成本直线下降,高通量测序技术逐渐应用在科研、医疗等各个研究领域得到广泛应用。伴随着大数据处理关键技术的突破、数据共享等契机的发展,大数据将在促进生物学发展中发挥重要的作用。 测序技术在生物学研究中的发展分成三个阶段:第一个阶段: genome c ...
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国外生物云平台简介
张栋 2016-6-10 23:34
随着近年来高通量测序技术的快速发展,基因数据呈现出指数增长,以高通量测序数据库 SRA(NCBI 维护 ) 为例, 2009 年数据收录量为 10TB , 2011 年接近 100TB , 2014 年突破了 1PB , 2015 年接近 5PB , 2016 年有望突破 10PB 。依赖于本地服务器与专业生信分析人员的传统数据分析模式已经难以 ...
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国内生物云计算公司简介
张栋 2016-6-10 23:29
在中国,在基因组学为代表的生物数据分析市场上,基于云计算的生物数据分析创业公司也开始涌现,下面为大家简单介绍下国内云计算生物信息公司的情况: 1) BGI online BGI Online 是由华大基因推出的基因数据分析的平台,它旨在为研究机构、医院等用户,提供专业高效、简单易用的生物信息云服务。通过 BGI Online ...
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大数据时代如何探索基因大数据的价值——lncRNA
张栋 2016-6-10 23:17
2015 年 Nature Genetics 发表的文章通过分析正常组织和各种常见类型癌症组织 7256 个转录组测序样本, 43T 转录组数据中鉴定得到 58,000 个 lncRNA ;发现上千种 lncRNAs 在癌症组织中特异表达,可以作为新的肿瘤标记物。 2014 年 Genome Biology 发表的文章通过研究 13 种组织和 30 个玉米 ...
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BMKCloud全新公共数据库上线
张栋 2016-6-10 23:11
2016 年 3 月,作为 BMKCloud 公共数据库项目的一部分,动物、植物、微生物高通量测序数据库正式上线。百迈客云的合作伙伴现在可以在 BMKCloud 上免费访问三大数据库了。在 BMKCloud 上将 PB 规模的高通量测序数据作为共享资源,用户无需下载数据,直接在 BMKCloud 上利用分析平台进行分析,加速了利用公共 ...
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