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  • 山西大学,生命科学与技术学院,副教授

    • 生命科学->生态学->生命科学

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生物信息小软件:在线BLAST(可批量) 2023-01-23
    有的时候,我们需要在线blast多个序列,如果逐个的往 NCBI blast页面 输入,比较繁琐,也比较费时。为此,利用python语言特编写了一个小程 ...
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小程序:从fasta序列中挑选出特定fasta序列 2022-10-23
    高通量测序后的序列fasta文件往往很大,利用EditPlus等打开往往只能打开部分,还有很多会被丢弃掉,导致查询不到。因此,利用python,写了 ...
(1740)次阅读|(3)个评论
抽奖小程序 2022-06-26
        举办一些活动的时候,如果需要进行简单抽奖,可以用本小程序,抽奖结果以excel形式储存到同一文件夹中。     &nb ...
(3101)次阅读|(0)个评论
从Excel文件中提取序列并以Fasta格式形式储存到txt文件中 2022-06-21
       本小程序可以从文件中提取序列及其名称,并以fasta格式形式储存到txt文件中。        小程序存贮在百度 ...
(4080)次阅读|(1)个评论
本地blast结果一键提取比对序列信息 2 2021-11-27
      利用 本地BLAST 一文编写的小程序BLAST后,结果里会出现两个文件:*_out_detail.txt文件和 *_out_simple.txt文件 。在“ 本地 blast ...
(2928)次阅读|(0)个评论
本地blast结果一键提取比对序列信息 2021-11-22
     利用 本地BLAST 一文编写的小程序BLAST后,结果里会出现*_out_detail.txt文件。如果手工从这个文件中提取比对Identities = 100%的序列信息 ...
(3702)次阅读|(1)个评论
小程序:用序列号实现从NCBI或Ensembl 批量下载序列 2021-11-09
    构建进化树的时候,常需要批量下载序列,尤其是重现文献上进化树时。为此,利用python语言写了2个小程序,能够实现从NCBI的GenBank和Ensembl批 ...
(5987)次阅读|(4)个评论
生物信息小软件:本地BLAST 2021-06-11
      高通量测序后会获得很多序列,一般公司都会进行注释,但是如果参考基因组或参考序列注释不完整的情况下,往往需要我们开展本地blast。NCB ...
(3894)次阅读|(4)个评论

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