下面是基本流程。详细过程等有空了再码字吧。。。

1. 用xds 处理数据。编辑xds.inp, 注意选择FRIEDEL'S_LAW=FALSE.

其余照常处理。

2. 用xscale scale数据。

3. 用xdsconv将数据convert成file.mtz.

4. 使用hkl2000（shelxCDE)寻找重初始原子位置， 调整不同的参数（estimate重原子的个数，使用不同的分辨率，不同的cycle等。正解的标志是 有一个很大的gap表明有一个distinct的population出现，并且两个hand之间的差距比较大。

5.使用sharp refine 重原子的位置并找到更多的重原子并进行density modification。 输入波长，重原子类型等参数。autosharp／sharp 也可以直接用来寻找重原子。

6.使用solve／resolve （phenix包含） 进行模型搭建。

另外一种alternative 是直接使用phenix solve／resolve 进行重原子的寻找和模型构建。