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【专稿】读这门课的过程中所想到的
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【专稿】读这门课的过程中所想到的
前文《春江水暖谁先知——学生最有发言权》已于7月12日发布了将在科学网悟空书斋（张星元的博客）陆续推荐发表学生在发酵原理课程讨论会上的发言稿的消息。
我准备在发言稿标题前冠以【专稿】的方式按已公布的目录陆续发稿，先发研究生的，后发本科生的。前面已经推荐发表了4篇意见一致的文章，现在发布一篇包含批评意见的文章。这次发布的是研究生孙×的《读这门课的过程中所想到的》，请指正。
研究生孙×：读这门课的过程中所想到的
我喜欢这句话的后三分之一，说的很好，“要创造人类的幸福，全靠我们自己”。但我不喜欢中间的三分之一：“我们仰慕这种神力，但我们不相信上帝”。因为这里面的“我们”没有包括我，我仰慕这种神力，但我也相信上帝。上帝是什么？记得在‰偶然的一份基督宣传页上这样写道：“上帝不是一个人，不是一个神，也不是一群神的集合；上帝是道，是存在于自然界中无所不在的规律。”就是这句话让我相信有上帝的存在，自然界中上帝无处不存在，也就是自然规律无处不在，只有坚信规律无处不在的人才能有坚定的科学信念，才能找出隐藏在事物背后的规律；马克思主义思想的精髓是事实求是，马克思主义的科学研究观要求我们在科学研究中要事实求是。就目前的科学而言一是自然规律的应用，一是自然规律的发现，从对自然规律的信仰这个意义上说对上帝的信仰和对马克思主义的信仰是一致的，在这里我并不是想讨论到底是有神的存在还是没有神的存在，我只是想告诉所有的科学工作者，在科学研究、交流和讨论的过程中千万不要让个人宗教信仰阻碍了我们前进的道路。
上面的一段话与发酵原理课程似乎并没有什么关系，但它的的确确是我在读这门课的过程所想到的；写在上面，希望张老师能够原谅。
似发酵原理的课我以前也学过一些的，但张老师的课给我的是另外的一种感觉，启发我思考了许多以前所没有思考过的问题。以下是我的一些感想，都是一些片段，写下来虽然不能成为一篇系统的论文，但我觉的还是有必要和张老师交流一下的。
一， 在张老师发酵原理这本书中出现了太多明显的个人信仰的观点
人类对微生物发酵的应用虽然已有几千年的历史，但现代发酵工程的发展如果从生产青霉素算起也就不到百年的历史，如果从真正的大规模生产甘油算起那就更短了。现在发酵生产的研究已走到了它的成熟阶段，但它与其它学科相比有许多不同之处，其它学科在发展之初就有了自己的原理，而发酵工程，一直发展还没有自己的原理，它所依靠的是微生物，生物化学，化工原理等学科的基础理论；在发酵生产研究走到自己的壮年的今天迫切需要自己的原理也成长起来，就在这个时候，张老师的发酵原理出现了，这是世界学术界的首创。要让这一原理走出去，我们不仅要摒弃宗教信仰的屏障，还要摒弃社会形态的屏障，这仅仅是一个学术问题，我们没有必要让它夭折在意识形态的屏障中。我想张老师书中出现过多的明显的马克思主义个人信仰的观点势必会影响其出现在有不同宗教信仰的科学工作者的书架。
二，代谢能支撑假说是否改为代谢能支撑理论更合适
自然界是一个完美的统一体，任何个体（有生命和无生命）都不能脱离其周围的环境面独立存在，这是自然界的公理。生命系统是一个开放的系统，永远不会达到平衡，它们通过将高焓低熵的基质转化成低焓高熵的代谢产物，不断地获得自由能。这早已被生命科学研究所证实，而且也符合自然界的运转规律。
三，代谢网络假说是否改为代谢网络理论更合适
代谢途径和输送系统在代谢物分子水平上整合，在辅因子水平上协调，形成横跨生物活细胞内外的代谢网络。代谢网络是细胞自主调节的无尺度网络，它作为一个整体来承担生物细胞的物质代谢和能量代谢。这一思想是在生物化学研究中首先发现ED途径后的许多代谢途径相继被发现的过程中逐渐形成的，生命细胞中的物质分子及它们之间的相互关联已被近代生物化学研究所证实，因此我们没有必要再称它为假说，而且在微生物学，生物化学中也都没有代谢网络假说这种说法，所以在以细胞整体为研究对象的发酵原理中我觉的还是把它称为代谢网络理论更合适。况且，称为假说似有对前辈功劳不敬之嫌，又有吞没前辈功劳之嫌，这对建立公平公正的学术风气是很不利的。
四，关于经典热力学
四，关于经典热力学
记得张老师在发酵原理课上讲热力学理论在生物体系中存在限制，我要课下查看了热力学相关书籍；我认为经典热力学与生物体系并不矛盾，经典热力学也能应用于生物体系的研究。当然，就像牛顿的经典力学存在限制一样，这样的限制经典热力学也同样存在；经典热力学理论是建立在孤立体系基础之上的，它的研究对像是一个封闭的体系，而且在理论建立之初的气体模型是假设体系内部各要素之间是没有相互作用的，这是一种理想模型，在得出结论之后，科学家把对它的应用扩大到了要素之间存在相互作用的体系之中，并且发现它也是适用的，就像它能应用于生物体系并也得一定的结论。但是经典热力学并不能解决生物体系的所有问题，这还取决于另外一个因素，即生物体系是一个耗散体系。经典热力学应用于生物体系能得出一定的有用信息说明经典热力学与生物体系并不矛盾。因此我们并不能说是经典热力学存在缺陷。
张老师的发酵原理课给了我许多思想启发，感谢张老师在繁忙的学术研究中为我们带来精彩的课堂。
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