回国后开始申请科研基金，主要是在申请国家基金委的项目，由于考虑到限项的因素，一般不参加课题，都是作为负责人来申请项目，两年中获得国自然面上项目2项、科学部主任基金一项，唯一没有拿到的是一项国际合作项目（海外青年学者合作项目，我作为中方合作者，申请者是我在美国博士后时的老板）。再就是北京市的一些留学和人才项目和教育部的回国留学启动基金。目前还没有涉及科技部的项目（973和863）。实话实说，从我的经验，国家基金委的项目申请还是比较公平、透明的，基本上能否拿到主要取决于你的研究背景和研究基础，我所看到的评审反馈意见都是很中肯和客观的，基本上都客观分析了申请标书的优缺点。只有一次一个评议人的意见是对我申请的项目数提出质疑，但实际上是他没有搞明白基金委的规定，所以也没有对申请造成任何影响。不足之处主要有下面几点: 1. 面上项目的资助力度不够强，大家都知道，现在做实验买东西，大多数都是从国外进口，中间商给我们实验室的价格都是在国外价格的基础上翻一倍，同类产品我们实际支出的钱，是国外同行的两倍，而面上项目的钱又非常少，这就极大的制约了作为一个完整的项目进行资助并且完成的可行性。自以为面上项目的资助力度应该达到60万左右，这样一个刚开始起步的实验室，3-4年之内有两个面上项目，就能够保证每年40万左右的科研经费,这些钱应该在不购置仪器的情况下，可以保证试剂耗材和5-6名研究生的津贴（按照中科院生物物理研究所的情况）。2. 对于有些评审意见还不错的标书未获资助的情况，没有较清楚和详细的说明，比如说5个评审人的意见中，有4个建议给予资助，只有1个有异议，但也并没有建议不予资助，这种情况往往让申请人很费解，如果能有更量化的指标，会更好！3. 各个学科之间的资助差别较大，有的学科有时候竞争很激烈，有的就会好一些，但一般申请人很难了解到这些具体情况，实际上基金委可以做一些信息公开，以均衡分布不同学科的申请数量。