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[转载] 【VASP实用脚本】 Material Studio一键获取POSCAR（可固定原子）的方法

已有 11829 次阅读 2019-9-27 17:45 |个人分类:第一性原理（vasp）|系统分类:科研笔记|文章来源:转载

脚本：xsd2pos.pl

下载：xsd2pos.pl

语言：Perl

功能：将Material Studio中建立的后缀名为xsd的文件直接转换为可供VASP使用的POSCAR

作者：武汉理工大学赵焱课题组

使用方法：

Material Studio中建模，需要固定的原子也固定好；我使用一个非常常见的Anantase TiO₂的（001）表面上，吸附一个CO分子为例。（具体如何切面，如何固定原子，在这就不赘述了，有很多教程）
将xsd2pos.pl脚本拖拽到你想要转换的xsd文件的文件夹下。
改名，在脚本中把要转换的结构文件的名字改过来；
运行脚本；
如果你在工具栏没找到这个按钮，就把它在View里面选择上；
最终的效果如下：
最后留个小问题：为什么用perl脚本，这个脚本又是怎么判断这个原子是否固定，并在后面标注F和T的呢？有兴趣的同学可以想一想。