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土壤中大丽轮枝菌微菌核的定量

已有 7872 次阅读 2013-2-11 13:04 |个人分类:轮枝菌|系统分类:科研笔记| xml

微菌核是大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)在土壤中的主要存活结构和黄萎病的初侵染来源。已报道检测土壤中大丽轮枝菌微菌核数量的方法有选择性培养基计数法、间接定量法、免疫测定法和分子生物学方法等。选择性培养基计数法比较常用,该方法受不同土壤类型和不同土壤微生物区系的影响,致使检测结果误差较大,且无法在形态上排除长孢轮枝菌(Verticillim longisporum)和三体轮枝菌(Verticillium tricorpus)等其它产生微菌核轮枝菌对计数的干扰;间接定量法灵敏度较低,需要标准化的生长环境(比如温度,土壤湿度),并且各个阶段(移植、病害评估、根部培养)都需要专门的标准化技术,不是一种真正意义上的定量检测方法,常用于抗病品种的筛选和生物防治效果的粗略评估;酶联免疫吸附测定法(ELISA)并不常用于土壤中大丽轮枝菌的定量;竞争PCR通过内参DNA对土壤中大丽轮枝菌进行相对定量。实时定量PCR以其特异性强、灵敏度高、快速准确等优点,成为土壤中病原菌绝对定量的新途径。对土壤中大丽轮枝菌微菌核进行定量是黄萎病监测和预警的基础。经过近5年的研究,我们建立的土壤中微菌核个数n与实时荧光定量PCR的Ct值之间的数量关系为n=e7.300-Ct/3.905。温室人工接种微菌核数量与棉花黄萎病发病率间的线性关系为y=2.710n+0.251(魏锋等,2013)


Wei F, Yu ZZ, Shang WJ, Yang JR, Xu XM, Hu XP*. Rapid detection and quantification of Verticillium dahliae microsclerotia in soil. Acta Phytopathologica Sinica, 2013, 43(5): 449-457.

Wei F, Shang WJ, Ma LJ, Yang JR, Xu XM, Hu XP*. Quqntification of Verticillium dahliae microsclerotia in soil using wet-sieving and qRT-PCR. Acta Phytopathological Sinica, 2013, 43(S): 528-529.

Feng Wei, Rong Fan, Haitao Dong, Wenjing Shang, Xiangming Xu, Heqin Zhu, Jiarong Yang,  and  Xiaoping Hu*. Threshold Microsclerotial Inoculum for Cotton Verticillium Wilt Determined through Wet-sieving and Real-time Quantitative PCR.  Phytopathology, 2015, 105: 220-229.

Feng Wei, Wenjing Shang, Jiarong Yang, Xiaoping Hu*, Xiangming Xu*. Spatialpattern of Verticillium dahliaemicrosclerotia and cotton plants with wilt symptoms in commercial plantations. PLoS ONE, 2015, 10(7): e0132812.




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