zd200572的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/zd200572


  • 南京申友生物,

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

    扫一扫,分享此博客主页
你需要登录后才可以留言 登录 | 注册


botingbei 2019-6-21 20:53
您好,赵老师。我是一名博士生,使用qiime2 的时候 有一个问题 想咨询。
在做diversity分析时,如果想只分析其中的一部分数据,也就是修改metadata,减少样本量。该如何进行呢?
我尝试了使用只含部分样本的metadata,并且敲入-p-ignore-missing-samples 但是还是将所有样本都展示在emperor中。
如果您有时间看到,并且回复我,真的非常感谢。
AmmyDK 2019-2-24 17:58
您好,看到您上传的检测数据,我是这个网站作者的学生,老板希望您看到以下回复,那个微信是他 的。 要是你的遗传材料不行,给我们发你的uniqueID. 发我一个电子邮件 [email]lasse.folkersen@regionh.dk[/email] -- 或者在微信lassefolkersen
AmmyDK 2019-2-24 17:58
您好,看到您上传的检测数据,我是这个网站作者的学生,老板希望您看到以下回复,那个微信是他 的。 要是你的遗传材料不行,给我们发你的uniqueID. 发我一个电子邮件 [email]lasse.folkersen@regionh.dk[/email] -- 或者在微信lassefolkersen
查看全部
统计信息

已有 264248 人来访过

ngs进行HLA分型的尝试 2020-10-13
Optitype 软件安装 最开始尝试使用docker,无奈悲剧的失败,发现bioconda有这个软件的,于是上conda,感觉比docker更方便呢。还有一个好处是,win10 ...
(340)次阅读|(0)个评论
如何快速查询人基因组的LD连锁不平衡信息 2020-10-13
最近做PRS评分,需要用到连锁不平衡信息,来进行位点筛选,找了好几个工具用于计算连锁不平衡,也发现了个好用的网页工具来进行查询,在这里和大家分享一下! ...
(353)次阅读|(0)个评论
QIIME 2 2020.8 更新学习 2020-09-05
QIIME 2 2020.8 版本现已发布!感谢所有参与的辛勤工作! 提醒一下,我们计划发布的 QIIME 2 计划于 2020 年 11月发布 (QIIME 2 2020.11),但请继续关注更 ...
(494)次阅读|(0)个评论
宏转录组学习笔记(三) 2020-08-27
这是封面这本书的学习笔记,前面的笔记在这: 1.宏基因组学习笔记 2.宏基因组学习笔记2 生物信息数据分析工具 QIIME(Quantitative Insights Into M ...
(473)次阅读|(0)个评论
QIIME2又双叒叕更新了 2020-07-03
更新亮点都有啥呢?大概是几个命令和以前不一样了。以下是发布详细信息: QIIME 2 2020.6 版本现已发布!感谢所有参与的辛勤工作! 提醒一下,我们计划发布的 ...
(758)次阅读|(0)个评论
[转载]GWAS和群体遗传学笔记 2020-06-14
最近听了菲沙基因的网课,记录一下!多数是其课程ppt的截图,如有侵权,立马删除。声明,和这个公司无利益相关,只是为了学习和分享知识。 群体遗传分析步 ...
(855)次阅读|(0)个评论
生物信息学数据管理习题 Python3 2020-05-15
这是我两三年前学习过的一本书,我觉得这本书挺好,把生物学的问题直接在python学习中解决了,推荐给大家,之前还整理了习题代码,分享一下。之前分享在了gi ...
(503)次阅读|(0)个评论
Nanopore 16S测序数据分析流程之last和centrifuge 2020-05-07
最近有朋友和我交流纳米孔16S测序数据的分析,发现真的没有从头完成过一次这方面的数据分析,然后发现这方面的资料也比较少,于是学习一下,和大家分享。坦白说 ...
(809)次阅读|(0)个评论

查看更多

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2020-10-21 02:04

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部