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应用Raxml软件构建最大似然法系统进化树
2019-5-28 14:59
各种组学数据红的热火朝天,学点生物信息傍傍身已经成了当代生物学老少的必经之路。虽然信息时代的软件层出不穷,大部分软件还没能达到兼容各种格式的程度,并且运行过程中定然会有不少坑,做个小分析简直如同去西天取经,时间都花在打怪上了。 所以,为了防患于未然,我们必须要在开始跑程序的第一天就把全网搜个遍, ...
个人分类: 生物信息|8513 次阅读|没有评论
我们的故乡究竟需要怎样的关怀
热度 3 2016-2-20 15:32
春节刚过,元宵节还未到来,一大批南漂北漂海漂们已经踏上了回岗的归程。 看到网上最新的各种返乡笔记,心中感慨万千。大部分的返乡笔记都记录了一副农村拜金风日盛,农民离乡务工,田地荒芜,传统习俗日益凋敝,中小学校倒闭或合并,高利贷盛行,老人小孩缺乏人文关怀等等。作为离乡背井,在外飘零了几年的穷学生,此次 ...
3184 次阅读|3 个评论 热度 3
在宁静的北欧小镇写论文
热度 1 2016-1-16 00:34
刚从 Lammi Biological Station 回来,鞋帽上还带着乡野的风雪,耳朵里还回响着画眉鸟的叫声,脑袋里还有即将完成论文的兴奋。这样的季节,在冰天雪地里,没有什么比点上一 盏灯,在山林之中写作更为惬意的事情了。 Lammi Biological Station 是赫尔辛基大学三大生物实验站之一,位于离赫尔辛基不远的 Hamenlinna 市 ...
3188 次阅读|3 个评论 热度 1
谈谈气候变化
热度 2 2015-12-4 08:54
巴黎气候大会正在进行。对于这项对全人类的生存息息相关会议,我们自然也应该加以关注。随着教育水平提升环境污染的加剧,越来越多人意识到气候环境的重要性。作为社会的一份子,节能减排也是我们义不容辞的责任,至少这是我们短期之内可以做的。频繁的人类活动,化石燃料燃烧,汽车尾气的排放,森林砍伐,草地开垦无一不 ...
2888 次阅读|4 个评论 热度 2
在芬兰申请巴西旅游/会议签证
2015-5-17 03:04
近期要从芬兰去巴西参加一个学术会议,需要办理签证。但由于我目前不在国内,而芬兰又是免签国,忽然觉的无从下手。看到网上也没有很多关于这类签证的帖子,就把我最近的经验写一下,希望能帮到大家。 会议的组织方已经在网站上写的很清楚,要去巴西开学术会议,只需要办理旅游签证。 其实旅游签证的办理很简单, ...
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也说一下jModeltest
2014-7-21 16:17
jModeltest一直都是用ML法做系统进化树筛选核苷酸替换模型的不二软件。该软件使用起来相当简单,但是运算参数的调整决定着你是否能得到最合适的进化树。如何判断哪个模型是最合适的呢?首先要从参数所代表的意义说起: 1.准备好你要用的DNA序列。下载jmodeltest 2.1.5,这是最新版本,在2014年4月份更新的。如果你用的wi ...
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