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[4]guojiazhong2010   2014-12-9 22:02
您好!不知道有没有做过RNA-seq数据的分析,看到你的分享的关于tophat-cufflinks体系的讨论,我在分析中也遇到一些问题!现在首先想问下,你手头有没有IGV的比较详细的在线或者离线说明文档,自己看了官方说明感觉还是粗糙!自己加载VCF文件后,好像页面并无多大变化。不知如何解决!!
[3]李蕾   2013-9-16 13:55
您好,我是南京理工大学经济管理学院管理科学与工程专业的一名博士生,最近想做一份用户打标签行为的调研(就是您在发表博文时会让您给博文添加标签),但是我缺少研究数据,恳请您在百忙中抽空帮我填写一份问卷,问卷大约需要您5分钟的时间,非常感谢您!!
      问卷地址是:http://www.sojump.com/jq/2709468.aspx 将此链接复制进浏览器的地址栏,然后按回车键即可,非常感谢您!!!
[2]zengjingyao   2013-7-30 14:21
您好,我现在正在做转录本的构建,用的是Cufflinks这个软件,我想请教下您构建完转录本之后,如何去评估转录本的完整性,您有看过的文献或者是您知道哪款软件能做吗,谢谢。
[1]林海   2012-9-25 21:54
你好,求教问题:
cytoscape在做基因或蛋白网络时,我看都是别人做好的网络,有些新测序的物种,怎么做啊?

谢谢!
我的回复(2012-9-26 21:52):我收集到以下三种说法:
1、cytoscape最基本的应用只是对网络进行可视化,但是它有很多可用来分析网络的插件;对于物种没有什么限制,只要有合适的网络就可以导入进行可视化。
2、利用interolog,借助orthoMCL
3、它只是网络的可视化并不能预测新的网络,就是你以特定的格式文件输入,它给你一个可以按照你的要求(比如node节点的颜色代表蛋白质,或是连接线的长短,粗细代表特定的意义(作用力大小等))的网络展示,以便于你对网络分析。还有就是可以从网上下载各种packgae,比如可以做GO的包等。。。
我的回复(2012-9-26 15:11):我也不知道。想了好久呢……

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