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miRBase plus之miRCarta -- 全面收集miRNA,新候选miRNA 2017-11-08
众所周知,miRBase是miRNA研究的金标准数据库。但是,自2014年6月以来,就没有更新过(文章中这样说的,具体没有查)。那么,这3-5年以来,所有新miRNA预测文章 ...
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用图形展示miRNA-seq中检测到的miRNA和未检测到的miRNA 2017-09-13
例如miRBase中有2000个人类成熟miRNA,miRNA-seq检测到了1500个,未检测到的为500个。如何用图形表示呢? 柱状图 饼图,例如 ...
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[转载]Python超越R,成为数据科学、机器学习平台领导者 2017-09-05
2016年,R第一,而2017年,R变第二了。 再看看python和R间人员转换情况。 要点: 1,python程序员更忠诚。91%的pythoner还在用python; ...
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我来给“最强大脑”出个题:虚拟/增强现实3D大分子“乐高”挑战 2017-08-14
前段时间迷上了“最强大脑”。不光选手惊人,道具也惊人。各种高科技,各种眼花缭乱。 记得有个“仓颉造字”和“乐高”的(具体选手名忘了)。 仓颉造 ...
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还在用条形图展示你的基因本体论(GO)富集分析结果吗?弱爆了 2017-08-10
尽管存在大量组学数据GO功能分析软件,但是,对结果的全面而详细的理解仍然是有挑战性的,主要是由于缺乏公开可用的可视化工具。 R包GOplot基于ggplot2增强图 ...
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环状RNA(circRNA)真的像夏天一样“热”吗? 2017-08-08
最近上海的天很热,40度都来了。有比上海更热的吗?有,环状RNA 1,什么是环状RNA? 简单地讲,就是exon淘气了,不串联了,开始互相“咬”了,咬成了环 ...
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[戏说]如何3个月发表一篇5分的circRNA文章? 2017-08-05
环状RNA最近非常热门,大有当初发现miRNA的浪潮。由于是“新”发现的一类RNA,所以目前处于“诸侯争霸”的战国时代。说的直白点,就是没有人研究过某物种的circ ...
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[转载]lncRNA TUG1与ROCK1竞争结合miRNA-335-5p促进骨肉瘤细胞侵袭 2017-08-04
TUG1表达升高后,吸附更多的miRNA,导致结合到ROCK1上的miRNA变少,因此ROCK1表达升高,促进骨肉瘤转移/侵袭。TUG1和ROCK1构成ceRNA(竞争性内源RNA)。 ...
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GMT+8, 2017-11-23 09:42

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