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代谢模型预测细菌多样性研究取得进展

已有 573 次阅读 2023-1-13 07:42 |个人分类:信息分析|系统分类:科研笔记

土壤生物多样极其复杂,通常少量土壤中就存在数十亿种生物,包括土壤微生物(细菌、真菌和原生生物)以及土壤动物(线虫)等。明确土壤生物多样性地理分布模式仍是一个巨大的挑战。以前的研究使用定性和图形框架等简单分析方法,仅仅包含少数共存物种或整体系统模型,侧重于突发模式但忽略了其潜在机制。著名生态学家James H. Brown等于2004年首次提出了定量评估不同尺度的系统中微生物多样性分布模式的框架,即生态代谢理论(MTE)。简言之,该理论预测个体的新陈代谢速率、种群增长率和物种数量随环境温度呈指数增长。众所周知,土壤pH值一直被认为是决定全球尺度不同土壤细菌多样性的主要因素。虽然生态代谢理论已被广泛用于动植物多样性的预测中,但在解释不同系统中细菌多样性分布模式时存在矛盾,这可能是因为忽视了pH值对土壤微生物多样性的影响。

https://www.ebiotrade.com/newsf/2023-1/20230113064919556.htm

http://www.pubmedplus.cn/P/SearchQuickResult?wd=52354fd7-1ec8-46b2-9c54-89abc4f90746

01.Genome, Bacterial108 篇100.000%
02.Phylogeny34 篇31.481%
03.Bacterial Proteins29 篇26.852%
04.Genomics21 篇19.444%
05.Animals18 篇16.667%
06.Bacteria18 篇16.667%
07.Models, Biological18 篇16.667%
08.Computational Biology17 篇15.741%
09.Humans17 篇15.741%
10.Models, Genetic17 篇15.741%




https://blog.sciencenet.cn/blog-280034-1371758.html

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