2021年3月，翼和生物合作单位，上海健康医学院附属周浦医院，在《DNA  AND CELL BIOLOGY》第40卷第3期发表题为《Identifying and validating differentially methylated regions in newly diagnosed patients with graves' disease》的文章，文中采用翼和生物Hi-MethylReseq技术，对前期全基因组甲基化芯片发现的DMRs在大量样本中进行验证，鉴定和验证GD疾病相关的基因及其差异甲基化区域，为研究甲基化修饰在GD疾病发病中的作用提供了证据。

研究背景

弥漫性甲状腺肿病(GD)是一种器官特异性自身免疫性疾病，与遗传和环境危险因素有关。表观遗传学，包括DNA甲基化、组蛋白修饰以及非编码rna，是整合环境因素与遗传相互作用的“桥梁”。越来越多的证据表明，DNA甲基化水平差异在GD的发病机制中起着重要作用。

研究方法

在之前的研究中，作者从3名GD患者和3名对照者中获取了用于MeDIP和DNA甲基化微阵列的DNA样本。本研究以32例新诊断的GD患者和30例正常对照为样本已启动以验证差异甲基化区域。如前所述，诊断为GD患者，随机选择对照组。利用生信分析的方法进行蛋白互作网络PPI分析和转录因子结合位点TFBS分析，DMRs验证采用亚硫酸盐扩增子测序法。

主要研究结果

1、临床样本特征分析

在本研究中，32例GD患者(女性19例，男性13例;平均年龄= 40.47 - 14.13岁)和30名正常对照组(17名女性和13名男性;平均年龄= 39.67岁- 6.51岁)被选中来验证差异甲基化区域。年龄(p = 0.773)、性别(p = 0.829)差异无统计学意义。GD患者的临床特征，包括性别、年龄、甲状腺大小、甲状腺功能等，见表1。

2、DMRs所在基因PPI网络

3、GD患者和对照组之间差异甲基化的CpG位点

结论

这项研究结果表明，全基因组甲基化芯片具有一定的局限性，因为MeDIP-chip价格高昂，往往分析的样本量较小。较小的样本量可能不足以对GD患者的甲基化状态做出准确的分析。这可能解释了为什么后续验证实验中的某些甲基化状态与来自MeDIP-chip的DMRs甲基化状态不一致。尽管如此，本文的研究仍然是第一个研究GD患者全基因组甲基化研究的后续验证，为GD发病机制中的DNA甲基化提供了大量有用的信息。总之，本文的结果表明这些基因在GD发病机制的表观遗传修饰中可能发挥作用，需要更多大规模研究来证实和总结本文结论。

本文的候选基因CpG位点的亚硫酸氢盐扩增子测序(BSAS)由上海翼和应用生物技术有限公司完成。

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