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新型靶向RAS突变的共价抑制剂 | MedChemExpress

已有 765 次阅读 2023-3-9 16:53 |系统分类:科研笔记

RAS (Rat Sarcoma)是一个 GDP/GTP 结合定位于膜内侧的蛋白,其与 GDP 结合是非活化状态,与GTP结合是活化状态。由 RAS-GDP 到 RAS-GTP 的转化需要 GEF(鸟苷酸交换因子)的作用,从 RAS-GTP 到 RAS-GDP 需要 GAP (GTP酶激活蛋白)的作用。该基因家族有三个成员,分别是 HRAS,KRAS,NRAS。研究表明20-30%的肿瘤患者都存在着 RAS 的突变,其中 KRAS 的突变占了85%,NRAS 和 HRAS 分别占12%和3%。

RAS 最容易突变的三个氨基酸是甘氨酸12(G12),甘氨酸13(G13),谷氨酰胺61(Q61)。G12和G13处于核苷酸结合口袋的周围,其突变将会产生一定的位阻效应,阻止水解所需的构象形成,进而抑制 GAP 诱导的 GTP 的水解。理论上 RAS 应该是一个治疗癌症的理想靶点,但是发现 RAS 蛋白30多年来,还没有一个针对 RAS 的药物被批准上市,这也让人们觉得 RAS 是不可成药的。



研究动态

近期一项研究发现,小分子化合物 ARS-1620(图1)是一个特异性靶向 KRAS-G12C突变体的抑制剂。其可以在体内外模型中选择性地靶向 KRAS-G12C 突变,进而抑制肿瘤生长。

图1. ARS-1620的分子结构式

研究人员在已报道的 ARS-853(图2)的基础上进行基于结构的药物设计,最后找到了以喹唑啉为母核的一系列化合物与 KRAS 有较高的共价结合活性,并且具有较好的类药性(图3)进一步分析该系列喹唑啉母核化合物的构效关系,最终得到了小分子 ARS-1620,其活性是 ARS-853 的10倍,且能与 Cys12 形成共价键(图4)

图2. ARS-853的分子结构式(图片来源《Cancer Discovery》)[1]


图3. 以ARS-853为基础设计具有喹唑啉核心骨架的KRAS共价抑制剂(图片来源《Cell》)

图4. ARS-1620的作用机理(图片来源《Cell》)

随后,研究人员分析了共价抑制剂 ARS-1620 是否会带来潜在脱靶效应,结果表明 ARS-1620 特异抑制细胞内的 KRAS-G12C 蛋白,而不会抑制其它具有半胱氨酸的蛋白,证明 ARS-1620 具有较少的副作用(图5)。此外通过全基因组分析,进一步验证 ARS-1620 抑制 KRAS 的下游信号通路。


图5. ARS-1620特异抑制细胞内的KRAS-G12C(图片来源《Cell》)

小鼠模型药物代谢动力学实验表明,口服摄入 ARS-1620 具有极好的生物利用度和血药浓度。药效学实验表明,化合物 ARS-1620 可分别在50 mg/kg和200 mg/kg的浓度下显著缩小 KRAS-G12C 肿瘤的体积,而且缩小的幅度与化合物浓度成正相关。然而具有 KRAS-G12V 突变的肿瘤没有受该化合物的影响,表明该分子特异性靶向 KRAS-G12C(图6)。此外,体内实验表明 ARS-1620 可以缩小多种具有 KRAS-G12C 突变的肿瘤的体积,表现出良好的选择性。


图6. ARS-1620生物利用度好且具有抗KRAS-G12C突变肿瘤的效果(图片来源《Cell》)


M君有话说:


本研究的关键意义在于发现了一个特异靶向 KRAS-G12C 突变体的抑制剂 ARS-1620,其在多个 KRAS-G12C 肿瘤模型中均具有良好的疗效,这将给靶向抑制 KRAS的药物开发带来新的启发。



参考文献:

[1] Matthew P Patricelli, et al. Selective inhibition of oncogenic KRAS output with small molecules targeting the inactive state. Cancer Discov. 2016, 6 (3): 316-329.

[2] Matthew R Janes, et al. Targeting KRAS Mutant Cancers with a Covalent G12C-Specific Inhibitor. Cell. 2018, 172(3): 578-589. 



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