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ADMIXTURE

已有 10534 次阅读 2015-1-24 05:05 |个人分类:bioinformatics|系统分类:科研笔记| Structure, default, setting

对于大数据,用structure软件进行population structure分析费时较长。admixture则是一个不错的选择


例如计算K从1-10的命令


for((K =1; K <=10; K++)); do ~/admixture_linux-1.23/admixture --cv=10


~/inputfile $K;done


cv default setting is 5



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