科学网—chenjianhai的博文

热度 1 陈俭海 2023-11-29 15:49

Walter Gilbert（瓦特吉尔伯特），因开发了早期基因测序方法，于1980年获得诺贝尔化学奖【1】。 1932年，吉尔伯特生于波士顿的一个知识分子家庭。其父是哈佛的经济学教授，母亲是儿童心理学家。文绉绉的家庭文化气息，妥妥的书香门第，吉尔伯特从小就不走寻常路。吉尔伯特7岁的时候，随父母迁往华盛顿特区，随 ...

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牛顿第一定律与达尔文自然选择学说的内在哲学统一性

热度 2 陈俭海 2023-10-8 11:14

在科学的长河中，英国诞生了无数伟大人物，其中有两位杰出的先驱者：17世纪的艾萨克·牛顿与19世纪的查尔斯·达尔文。这两位在物理学和生物学领域独立地探索，似乎风马牛不相及。但是我认为他们的核心思想和发现，具有深刻的理论共鸣：外部力量对发展演化的决定性作用。事实上，这两位英国巨人被同地安葬 ...

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分子演化英雄谱之-李文雄

陈俭海 2022-6-17 09:02

生命科学巨人第二辑-李文雄这一期要介绍的是华人演化生物学家 - 李文雄。在求知阶段，少年李文雄的成长并非经典的逆袭式励志故事。天性乐观、兴趣广泛，善于思考是他的标签。他曾一度幻想成为小说家。高中时代他对未来充满了想象，对常识的本质感兴趣。虽然最好的科目是数学、化学、物理，但是他就像大多数年 ...

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医学疾病的易感性差异

热度 1 陈俭海 2021-8-22 12:27

疫病的易感性差异，是一个很常见的医学遗传学问题。不同社会阶级、种族、年龄、性别、组织器官、细胞类型，疾病的易感性、症状都不一定一模一样。对不同民族来说，容易感染的疾病都不尽相同。原因主要是跟民族起源以及“始祖效应”（founder effect）有关。所谓“始祖效应”，简单来说，就是祖先含有某一些易 ...

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The legacy of Richard Lewontin（理查德.陆文顿先生的遗产）

热度 1 陈俭海 2021-7-10 20:10

The legacy of Richard Lewontin（理查德.陆文顿先生的遗产）陈俭海 jianhaichen@scu.edu.cn 一个好的物理学理论，让人看到更真实的宇宙。一个好的生物学理论，可以让人重新认识「自己」。这可能是 Richard Lewontin（理查德·陆文顿）先生的发现带给后人的启发。 ...

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人和猩猩在几百万年前才分道扬镳，科学家是怎么知道的？

热度 2 陈俭海 2021-4-6 00:57

人和猩猩在几百万年前才分道扬镳，科学家是怎么知道的？陈俭海 jianhaichen@scu.edu.cn 科学研究是离不开逻辑和想象的。抽象理论的提出，往往是知识产生的起点。一个逻辑理性人，对抽象概念和理论，天然难以免疫。“自由意志”、“看不见的手”、“自然选择”、“化学元素”、“重力”、“引力波 ...

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DNA双螺旋的发现者詹姆斯沃森曾经只想静静的看鸟

陈俭海 2021-2-25 01:09

以下是詹姆斯·杜威·沃森（James Watson）在芝加哥大学的入学卡片。来自一位著名芝加哥大学教授。我有幸目睹这来自1943年学籍卡片，思绪翻飞。最近又无意间看到沃森如何发现DNA的一些趣事。首先的一个问题是，沃森DNA结构的发现，真有那么伟大吗？随便搜了一条，看到一条对DNA双 ...

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分子演化中性理论论战

热度 1 陈俭海 2021-2-16 16:49

1968年Kimura提出中性理论（ Kimura, M. (1968). Evolutionary rate at the molecular level. Nature 217, 3. ），认为物种间的差异主要是中性突变导致的。后来经过其弟子兼同事太田朋子Ohta完善为近中性理论 (nearly neutral theory of molecular evolution)，从数学上阐述为轻微有害的基因突变可以 ...

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演化的补锅匠

陈俭海 2020-11-8 18:19

诺贝尔奖得主，法国分子生物学家Francois Jacob，1977年6月在science发表了一篇著名的关于基因进化理论的个人评述文章，叫Evolution and Tinkering。最早接触这样的文章是在芝加哥大学的课堂上，当Manyuan Long教授激情洋溢的聊起这篇文章，有一种超越科学之外的魅力。读这样的文章，需要配一壶茶。科学家中少见的浪 ...

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GATK4的新功能GenomicsDBImport

陈俭海 2020-10-9 15:09

研读GATK最佳实践的研究者可能被以下描述所吸引： Prior to GATK4 this was done through hierarchical merges with a tool called CombineGVCFs. This tool is included in GATK4 for legacy purposes, but performance is far superior when using GenomicsDBImport, which produces a datastore instead of a GVCF fi ...

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