大部分的生物信息学的生信工作者使用perl语言作为数据分析语言。对于非计算机出身的人而言，配置一个好的perl环境也有一定难度。

   从新更换了一台电脑，就把如何在windows下配置perl及bioperl做了记录。

   首先从perl的官网https://www.perl.org/  下下载最新版本的activeperl，我这里下载的是ActivePerl-5.20.2.2002-MSWin32-x64-299195。直接双击进行安装，默认会安装在c盘，这样我们就安装好了perl。通过perl -v 来检验是否安装成功。如果安装成功，会显示perl的版本信息。

   接下来，就需要安装bioperl，安装bioperl可以通过ppm或cpan安装。从cmd命令下输入cpan回车，发现有两个错误，一个错误就是缺少c环境，一个是ppm没有安装成功。我们首先解决ppm的安装问题。ppm安装失败主要是由于windows下的中文名不识别，只需要更换ppm的路径就好了，即在windows环境变量中添加（ACTIVEPERL_PPM_HOME=C:Perl64bin)就可以了。从新打开一个cmd窗口，输入ppm，就会弹出ppm的友好界面了。

  然后解决c环境问题，perl需要gcc的编译环境，主要有三个版本，随便一种就可以。可以通过

ppm install MinGW

命令来直接进行安装，也可以通过ppm的界面进行安装（界面安装很简单就不贴图介绍）。

  最后就是安装bioperl了，一般安装bioperl前要安装DBI，cpan上直接install DBI就可以，可能会安装不上，不要着急，在cpan中输入i /DBI/ 多安装结果版本的就可以。ppm中，搜索DBI关联的模块，一起安装就可以了。安装bioperl，从cpan中安装的时候，首先也要看 i /bioperl/ 显示有20多个版本的bioperl，从前向后安装十几个就差不多可以了。安装中出错误了也不要怕，这几个模块是相互依赖的，没成功，后边安装可能就安装上了。ppm安装bioperl就简单了，同样搜多bioperl安装的时候要选择view all packages,直接安装就可以。安装完成后，从新打开一个cmd窗口，输入perldoc Bio::SeqIO 来检查是否安装成功，如果失败会提示不识别。

   到此，windows下perl的环境基本就差不多了，如果需要什么模块，建议使用ppm安装，简单有效。不过，cpan的资源一般比较新，ppm上没有的可以使用cpan安装。关于windows下perl环境还有什么问题，写的不对的地方，恳请指点;如果还有不清楚的，也请直接留言。