Barplot默认的参数

      barplot(height, width = 1, space = NULL,

       names.arg = NULL, legend.text = NULL,beside = FALSE,

       horiz = FALSE, density = NULL, angle =45,

       col = NULL, border =par("fg"),

       main = NULL, sub = NULL, xlab = NULL,ylab = NULL,

       xlim = NULL, ylim = NULL, xpd = TRUE,log = "",

       axes = TRUE, axisnames = TRUE,

      cex.axis=par("cex.axis"),cex.names=par("cex.axis"),

       inside = TRUE, plot = TRUE, axis.lty =0, offset = 0,

       add = FALSE, args.legend = NULL, ...)

density:底纹的密度。默认值为NULL

angle：设置底纹的斜率

names.arg:边框的名字

xlim和ylim:设置图形x轴与y轴的范围。

xlab和ylab：设置x轴与y轴的lable

axes:逻辑参数。设置图形是否显示x轴或y轴。(如果TRUE，垂直（或水平，horiz如果是真实的）轴绘制)

las：与axes参数相对应，表示坐标轴label的方向（0和1）

plot:逻辑参数。设置是否显示条形图。

beside:逻辑参数。如果FALSE，那么将绘画堆叠式的条形；如果是TRUE，将绘画并列式条形。

cex.axis:设置坐标轴数值的膨胀率。比如cex.axis=1.5

cex.names: 设置条形标签（barlabels）的膨胀率。比如cex.axis=1.5

col: 设置条形底纹或者填充颜色。

border：设置条形边缘颜色。如果设置为NA，则消除了边缘

width：设置条形的宽度

axis.lty:设置x轴的类型（类似lty）。默认axis.lty=0

names.arg:设置条形标签（barlabels）。

horiz：逻辑参数。设置图形是水平或是垂直

space：设置各个条形间的宽度。相当于各个条形宽度的一部分。

axisnames：逻辑参数。设置是否显示条形标签

xaxt= "n" 去除横坐标

yaxt =  "n"去除纵坐标

legend.text = 是添加文本

args.legend 文本的位置topright，topleft，（args.legend = list(x = "topleft", cex=2)）

add = “TRUE”将barplot加在目前已经有的图上

添加坐标轴的标签

axis(side=1, c(-2, 0, 2),tcl=-0.2, labels=FALSE)#添加坐标轴，slide=1代表横坐标，slide=2代表纵坐标，tcl的值代表添加坐标轴的那个刻度的长度，

图例函数legend()主要参数解释：

除了利用x,y设置图例的坐标外，用”topleft”， "center"，"bottomright"等设置位置非常方便。ncol设置图例的列数,  horiz设置图例的排列方向。常有的参数还有col，lty，pch

1.  legend(x,y = NULL, legend, fill = NULL, col = par("col"),

      border="black", lty, lwd, pch,angle = 45, density = NULL, bty = "o", bg = par("bg"),

      box.lwd = par("lwd"), box.lty= par("lty"), box.col = par("fg"),

      pt.bg= NA, cex = 1, pt.cex = cex, pt.lwd = lwd,

      xjust = 0, yjust = 1, x.intersp = 1,y.intersp = 1,

      adj = c(0, 0.5), text.width = NULL,text.col = par("col"),

      merge = do.lines && has.pch,trace = FALSE,

      plot = TRUE, ncol = 1, horiz = FALSE,title = NULL,

      inset = 0, xpd, title.col = text.col)

x和y:设置图例在图片上的位置。

title：设置图例标题。（在图例盒子里）。

title.col：设置图例标题的颜色。

text.col: 设置图例中文本文字的颜色。比如说：text.col=’red’。

text.width: 设置图例文本文字的宽度。宽度比例与x轴相关。

trace：逻辑参数。如果设置为TRUE，那么显示出函数计算过程。

fill: 设置一个填充了指定颜色的盒子放在文本旁边。

border：指定该盒子的边缘颜色。

lty与lwd：设置图例中线条的类型以及粗细。

density与angle:设置图例中小盒子的底纹密度和角度。

bty:设置图例盒子的类型。只能选择o或者n。

bg：设置图例盒子的背景颜色。

box.lty/box.lwd/box.col：设置图例盒子边缘线类型，粗细，颜色。

pt.bg：设置图例中点的背景颜色。

pt.cex：设置点的膨胀率。

pt.lwd：设置点的边缘线的粗细。

xjust与yjust:上下调整图例的位置。

x.intersp与y.intersp：设置图例盒子空间大小。

ncol:设置图例显示的列数。

horiz:设置水平方式显示图例。默认为垂直方式显示

1. hist()： breaks设置每个柱的间距；freq柱图表示count或frequency；polt设置是否画图；density和angle可以设置柱上的斜线；axes设置是否需要画坐标轴； cor设置柱图的颜色；border设置柱图边界的颜色；xlim设置横轴范围；ylim设置纵轴范围。

2. layout()：mat用矩阵设置窗口的划分，矩阵的0元素表示该位置不画图，非0元素必须包括从1开始的连续的整数值，比如：1……N，按非0元素的大小设置图形的顺序。widths用来设置窗口不同列的宽度，heights设置不同行的高度。par()的mfcol,和mfrow参数也有类似layout的功能，不过相对layout就逊色多了。

3. par()：mar设置图离四个边缘的距离；bg设置背景颜色；xaxt和yaxt设置坐标轴标签的类型（=”n”表示不画轴标签）；xlim和ylim设置坐标轴的范围。

4. axis()：las设置坐标轴标签的方式（水平，垂直……）。

5. mtext()：为四个坐标轴添加标签。

6. text()：在给定坐标的位置写字。

7. lines()：lty设置线的类型；lwd设置线的宽度。

8. points()：pch设置点的类型。

9. plot()：最简单的画图函数。type设置画图的类型（type=”n”表示不画数据）；axes设置是否画坐标轴。常用的参数还有：xlim和ylim，xaxt和yaxt。

10. heatmap()：Rowv和Colv设置是否需要按行或列聚类；scale设置是否需要按行或列标准化；na.rm设置是否移去NA；RowSideColors和ColSideColors可以在行或列边缘添加颜色；keep.dendro设置是否画聚类树。

11. dendrogram()：'nodePar'和'edgePar'都是list，可以方便的设置节点和边的各种属性，如：颜色，样式，宽度，标签……。