最近在处理snp标记，需要对1万左右的snpmaker进行标记定位，本来打算用mapmaker，结果数量有限制，试用了一些其他软件，结果也不是很理想，闫双勇老师实验室的软件可以用，当标记距离很近时，标记顺序会出错。最后没办法，先把标记按染色体分，然后再用mapmaker3.0，结果运行起来花很多时间。有更好的解决方法，可惜软件用不到，不过我想恐怕也需要花精力吧。

   如果只是几个标记，mapmaker还可以，如果几千个就不行了。有的时候前辈告诉你的经验，在新的形势下可能不能用，或者有新的方法。

 还不得不听前辈的话，按照他的说法做，最后告诉他做不成，ok，换。

 我认为，解决问题最直接的方法就是向那些做过相同分析的人直接请教，而不是类似分析的人，只有做过的才了解一些细节问题。