作为国家“211工程”首批建设的二十来所高校之一，具有光荣校史的吉林工业大学于2000年6月12日与原吉林大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院合并成为新的吉林大学。 　　参与联合合并后的原吉林工业大学的主要院系和专业都完整地保留下来了。以老吉林工业大学汽车工程学院、机械科学与工程学院、交通学院、材料科学与工程学院、生物与农业工程学院、管理学院、信息科学与工程学院通信与控制工程系为主体、在分别整合原吉林大学、原长春科技大学、原白求恩医科大学、原长春邮电学院、原中国人民解放军军需大学的相关院系后易名为新的吉林大学汽车工程学院、吉林大学机械科学与工程学院、吉林大学交通学院、吉林大学材料科学与工程学院、吉林大学生物与农业工程学院、吉林大学管理学院和吉林大学通信工程学院。原吉林工业大学人文、公共外语、大学数学教研室等并入原吉林大学的相关学院。原校址现称吉林大学南岭校区。