赖江山的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/laijiangshan 生态、统计与R语言

留言板

facelist

您需要登录后才可以留言 登录 | 注册


IP: 218.2.227.*   [31]赵军   2015-1-4 19:01
赖老师好,CANOCO4.5在windows8.1系统上用不了,是系统的问题还是软件压根不支持win8啊?
我的回复(2015-1-10 11:09):不支持,建议用R
我的回复(2015-1-5 06:32):不支持win 8
IP: 202.38.94.*   [30]黄涛   2014-10-28 09:39
赖老师您好,什么时候再有关于R语言的讲座, 想了解一下,谢谢!
我的回复(2014-10-30 06:16):我下周一二在云南西双版纳热带植物园有一个两天的讲座。如果有兴趣的话,请给跟我联系lai@ibcas.ac.cn
IP: 124.117.210.*   [29]马玉   2014-5-28 14:40
赖老师您好,读了您关于CANOCO方面的博文,受益匪浅,还有一个问题没弄懂,希望老师不吝赐教。就是一般文章里面将物种样方做完排序后,会做个相关分析,比如DCA第一轴与样地到海岸线间距离的回归分析
,这个回归分析如何做呢?也就是说如何将DCA第一轴具体化,这个问题实在没弄明白,研究好久了,希望老师能点拨点拨,谢谢!
IP: 159.226.163.*   [28]aiying31   2014-3-24 17:04
赖老师您好,CanoDraw中export statistics 中N2 diversity of samples,N1 richness of samples,N2/N1 evenness of samples是指的什么?
IP: 59.72.120.*   [27]dinglinjie   2014-3-22 14:05
   赖老师您好:
       我是吉林大学的一名研究生,非常感谢您对于多样性分析数据和经验的分享,看了您的文章和博文,我已经会做基本的分析了。作图的时候遇到一个问题,总也找不到问题的原因,还望赖老师指导一下。我用基于R语言的vegan软件包做CCA分析,有十三个环境因素,但是图做出来只有位于前四列的四个,其他的都没有显示出来,赖老师,您说这是什么原因呢
IP: 27.154.55.*   [26]黄兆斌   2014-3-6 11:06
赖老师好!
我是做微生物生态方面的,但是生态学理论基础不够好,研究生有学习过生态统计的简单理论,比如欧式距离等,但是经常碰到一些生态术语,认识不深,比如变换多元ANOVA检验等,所以想让赖老师推荐一本生态统计方面的理论书,包括理论,计算,结果输出解读。
谢谢
IP: 210.73.35.*   [25]叶琴   2014-1-3 14:18
赖老师好:
接触canoco软件差不多有一个月的时间,算是新手,基本的作图算是弄懂了,但是做CCA时一定要将环境因子的数据标准化吗?怎么标准化呢?因为我的环境因子都是正值,所以采用了开平方的方法,但是发现,标准化前后图形变化很大~就不知道要怎么办了~
IP: 221.0.236.*   [24]jianjianxiaohe   2013-12-5 14:14
赖老师您好。
我想请教您, Canoco 5升级后,经典的R语言vegan 包还能实现 Canoco 5目前的功能么?不知道您是否比较过。如:Bray-Curtis、Gower 距离、Jaccard 系数等距离计算,以及PCoA和
db-RDA分析等。
谢谢您。
我的回复(2013-12-27 07:19):vegan包可以运行上面这些分析
我的回复(2013-12-27 07:19):vegan包比CANOCO强大,而且正在不断更新添加新方法。
IP: 222.173.84.*   [23]lougiven   2013-12-4 21:26
赖老师您好,想请教您一下,R里面adonis 这个函数的检验的结果 是按环境因子的顺序依次计算的,类似于cca/rda 用anova(by="terms")检验的结果。想问一下,这个结果和envfit 的结果 能对应起来吗? 它们又分别适用于哪种情况呢?谢谢您
IP: 111.9.35.*   [22]sagulaji   2013-11-26 12:28
赖老师您好,我最近想用canoco进行微生物与环境的cca分析,有看到文章中有蒙地卡罗检验,他p值只有一个≦0.05.可是我看文章中环境因素有8个,我想问他这样写是总体的p值吗?如果不是每个环境因素都是p≦0.05,那应该怎样分析呢?谢谢
我的回复(2013-11-30 07:26):总体p值小于0.05,是个综合值。如果每个环境因子,需要进行单个环境因子进行分析。
IP: 222.240.169.*   [21]王圣洁   2013-10-31 17:38
老师您好,我最近想利用canoco进行不同微生物种群间PCA分析,用于分析这些微生物种群结构的差异。看到你翻译了canoco这部书,很希望能够你给我提供以下翻译稿。第一章我能够下载,其他几章好像下载不了。如果可能的话,烦请发送到我的邮箱:wsjguoyang@126.com
我的回复(2013-11-30 07:26):书所有的内容都在博客上了。
IP: 159.226.73.*   [20]徐飞   2013-10-21 13:05
赖老师您好,我是CANOCO初学者,看到您翻译的一本书“基于CANOCO的生态学数据的多元统计分析”一书,可惜没有出版,无法购买,请问老师能否提供电子版图书。另外请教赖老师一个幼稚的问题,CANOCO中能不能分析环境因子对样点分布的影响。非常感谢,本人邮箱1021449273@qq.com
我的回复(2013-11-30 07:27):都是博客上了。
IP: 117.22.28.*   [19]李蕾   2013-10-8 09:41
老师您好,我是南京理工大学经济管理学院管理科学与工程专业的一名博士生,最近想做一份用户打标签行为的调研(就是您在发表博文时会让您给博文添加标签),但是我缺少研究数据,恳请您在百忙中抽空帮我填写一份问卷,问卷大约需要您5分钟的时间,非常感谢您!!
      问卷地址是:http://www.sojump.com/jq/2709468.aspx 将此链接复制进浏览器的地址栏,然后按回车键即可,非常感谢您!!!
IP: 192.168.0.*   [18]袁顺波   2013-4-8 10:33
尊敬的科学网博客用户:
您好,诚恳地邀请您参与“科学网博客用户持续使用的影响因素”问卷调查,网址是:
http://www.sojump.com/jq/2250398.aspx,本次调查需要3-5分钟的时间,非常感谢!
IP: 159.226.110.*   [17]王瑞丽   2013-3-4 10:48
赖老师,你好,canoco在win7系统下无法正常运行,在analyze时出现错误提示,请问如何解决?
我以管理员身份进入 还有下载runasdate后,都还是出现错误?难道win7系统用过不了canoco吗?
IP: 202.101.215.*   [16]陈传红   2013-2-2 11:00
赖老师:您好!很是冒昧!我是华中师范大学生科院的一个研究生。曾经看过您写的一些有关生态学方面的统计分析与软件运用的文章和ppt,写的很好,给了我很大的帮助。现有一个问题需要向您请教下,最近一篇文章就是审稿人提到:“ These are very striking changes - particularly the coherence between the diatom assemblage changes (PCA) and winter air temperature. Would it be possible to apply some sort of regime shift calculation (i.e. breakpoint analysis) on the temperature data? ”
    为此特向您请教下,breakpoint analysis 这种数据分析方法采用什么统计分析软件进行分析呢?我利用百度搜索和google搜索及其学术搜索引擎搜索了这个分析方法,但都没详细的介绍。不知道赖老师你以前是否用过这种数据分析方法?特向您请教,在此先谢了!

  陈传红
IP: 110.200.58.*   [15]aiying31   2012-12-27 17:06
赖老师你好,请问如何在CANOCO中找到各个样点在第一排序轴的得分
我的回复(2013-2-28 11:30):用记事本打开 .sol文件
我的回复(2013-2-28 11:27):用记事本打开一个.sol的文件
IP: 210.72.68.*   [14]科任改弟   2012-7-25 17:21
请问,用R软件做出来的图,怎样修改图里面的标签,比如不同的样地用不同的符号表示。或者样地名称想修改一下。应该怎么做?谢谢老师。
IP: 218.205.222.*   [13]雷霆   2012-6-26 11:07
Janson 老师,您好! 我是北京林业大学一名青椒,正在学习使用R做一些多元统计分析,有两个问题请教您一下。
1. 我有植被数据和一系列环境数据,环境数据部分是实测的、部分是搜集的资料,在做CCA时发现有弓形效应。是否有个方法能对环境因子进行初步筛选,剔除一些自相关较强的因子,仅保留对植被数据影响显著的?
2.NMDS与其他的排序方法相比有什么优缺点?我不太理解为什么要采用这种方法。
希望您能抽时间指导一下,万分感谢!
IP: 111.142.117.*   [12]董纯明   2012-5-19 21:01
赖老师,我最近想利用canoco进行不同微生物种群间PCA分析,用于分析这些微生物种群结构的差异。看到你翻译了canoco这部书,很希望能够你给我提供以下翻译稿。第一章我能够下载,其他几章好像下载不了。如果可能的话,烦请发送到我的邮箱:donnytio@163.com

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-1 06:06

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部