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Python应用指定路径下的模块

2015-10-21 10:34

最近自己写了一些方便以后使用的基因组模块,开始只是放在执行目录,后来想想不方便,便查一下怎么样可以一直默认调用,结果找到两种方法,分享如下: 1,永久导入 import sys sys.path 查看到所有的包安装目录,让后把自己的包放进去就可以导入了! 2,单个导入 比如：想引用/home/genome/目录下的 ...

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对生物信息学的过度数学化的思考

热度 1 2014-6-10 22:43

生物学的研究基本上不会用到除了初等数学之外的数学内容，在现代生物学的科研论文里面也基本上看不到任何高等数学的公式，但是当你翻开任意一篇生物信息学的论文的时候，在你眼前的是长篇累牍的矩阵、微分、差分等高等数学方程和模型。我觉得现在生物信息学的发展是过度数学化的。 数学与生物信息学的关系可理解为形式 ...

个人分类: 系统生物学作业|3958 次阅读|1 个评论 热度 1

对冗余和基因冗余的思考

热度 4 2014-3-12 11:55

在百度百科上我得到冗余的解释是这样的：冗余，指重复配置系统的一些部件，当系统发生故障时，冗余配置的部件介入并承担故障部件的工作，由此减少系统的故障时间。没有冗余的系统是脆弱的，经不起外界随机事件的干扰，必须具有足够的冗余，它才能维持其结构和功能的正常进行。 在生物界里面的冗余是经常可以看见的，比 ...

个人分类: 系统生物学作业|17092 次阅读|4 个评论 热度 4

关于python中re模块split方法的使用

2014-3-12 11:30

今天在写一段小代码的时候需要用到 re.split() 方法，在使用的过程中发现了一个以前不知道的新用法，发现这个用法还是挺实用的，就把它记录下来： m = re.split( ‘d+’ , ’dkjj23jjjj44’) m m = re.split( ‘(d+)’ , ’dkjj23jjjj44’) &n ...

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