有的时候，我们需要在线blast多个序列，如果逐个的往NCBI blast页面输入，比较繁琐，也比较费时。为此，利用python语言特编写了一个小程序，以方便使用。软件分2个版本：（1）版本一（blast_online2htmlV1.0.exe）是将blast结果以html形式存储，并将比对上的前5个序列信息提取到excel文件中；（2）版本二（blast_online2xmlV1.0.exe）是将blast结果以xml形式和tab形式存储,，并将比对上的前5个序列信息提取到excel文件中。如果您习惯于NCBI blast结果传统的界面，建议使用版本一。

下载地址：

            链接：https://pan.baidu.com/s/1jKv3GC7-eOjBUbkPiOyozQ 

            提取码：3rol

使用说明：

        1. 拟比对的序列以fasta格式的形式存储在记事本（.txt）文件中。

        2. 将此.exe文件和上述的.txt文件放在任一文件夹中，双击后根据提示操作即可。

        3. 如果是blast_online2htmlV1.0.exe，运行的html请在output_html_*（*为比对的txt文件名）文件夹内查找，每个序列生成一个单独的html文件，前5个序列的统计结果直接在本文件下的blast_results_html_all.xlsx文件中。

        4. 如果是blast_online2xmlV1.0.exe，运行的xml请在output_xml_*（*为比对的txt文件名）文件夹内查找，每个序列生成一个单独的xml文件；运行的tab请在output_tab_*（*为比对的txt文件名）文件夹内查找，每个序列生成一个单独的tab文件；前5个序列的统计结果直接在本文件下的blast_results_xml_all.xlsx文件中。

        5.可实现blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx五种方法；目前可比对的核酸数据库有：nt、est、wgs、refseq_representative_genomes和refseq_rna；目前可比对的蛋白数据库有：nr、wissprot、pdb、env_nr和tsa_nr，如果特殊需求，请联系我。

注意事项：

    1. 本程序仅适用于win10、win11操作系统。

    2. 比对的序列尽量不要超过50个；如果比对的序列更多，建议使用本地blast，具体可参考前面发表的生物信息小软件：本地BLAST。

    3. 如果有一定数量的序列，尽量在美国东部时间晚上九点——早上5点之间，或者周末。美国东部时间夏令时比北京时间晚13个小时(3月的第2个周日开始到11月的第1个周日结束)，非夏令时比北京时间晚12小时，大致来讲，大陆的同学尽量不要在下班时间使用本小程序。

    4. 每次运行程序（连接服务器）需要间隔10秒以上。

    5. 不要把相同的序列在1分钟内提交2次及以上（即：提交fasta格式的序列尽量不要有既重名又相同的序列），要间隔至少1分钟以上。

致谢：

        1. python 社区（https://www.python.org/）。

        2. Biopython、CSV、 openpyxl、BeautifulSoup和colorama软件包的开发者、维护团队及资助者。