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论mafft比对中算法的选择
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mafft比对感觉很简单，在linux系统中按照流程的提示一步一步即可。其中有一个参数的选择，如下图所示：
本来以为随便选一个就可以，选了第3个，即默认选项，结果做出来的进化树总是有个别分支不正确，最后换成了第4个选项，即G-INS-I算法后，进化树的分支就完全正确了。看来这个容易被忽略的选项确实能够产生不同的结果。
https://blog.sciencenet.cn/blog-3466674-1290774.html
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mafft比对感觉很简单，在linux系统中按照流程的提示一步一步即可。其中有一个参数的选择，如下图所示：
本来以为随便选一个就可以，选了第3个，即默认选项，结果做出来的进化树总是有个别分支不正确，最后换成了第4个选项，即G-INS-I算法后，进化树的分支就完全正确了。看来这个容易被忽略的选项确实能够产生不同的结果。
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GMT+8, 2024-5-8 18:47
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