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[转载]每日科研进展 l 2023.01.17 l 果蝇中肠特异性靶标的筛选和基因表达差异分析

已有 753 次阅读 2023-1-17 10:08 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载

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果蝇中肠特异性靶标的筛选和基因表达差异分析

斑翅果蝇 (SWD)、铃木果蝇 (Drosophila suzukii) 是小果实和樱桃的主要害虫,通常使用常规杀虫剂进行管理。已经研究了 RNA 干扰 (RNAi) 技术,以开发 SWD 的替代防治方法。之前的 RNAi 工作表明,RNAi 对 SWD 的功效是有限的,因为双链 RNA (dsRNA) 在通过果蝇的中肠膜之前被中肠核酸酶(= dsRNA − 降解酶)降解(图 1)。

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 图 1. 通过 RNA-Seq 测量 dsRNase 基因在铃木果蝇中肠中的表达

为了克服这一障碍,RNAi 直接靶向中肠基因,从而消除了 dsRNA 穿过中肠膜的需要。这项研究的主要重点是确定果蝇成虫中肠的基因。我们使用转录组学分析比较了中肠和全身其余部分之间的差异基因表达。我们发现在中肠中有 1921 个基因被上调,1834 个基因被下调(图 2)。 

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图 2. 中肠特异基因表达

我们选择了 10 个参与各种生物学功能的中肠特异性上调基因,并确认了它们的基因表达(图 3)。

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图 3. RNA-Seq 测定果蝇中肠膜蛋白基因的表达

特别是,本研究中发现的中肠膜蛋白将成为未来开发 RNAi 和其他控制 SWD 的生物工具的潜在目标。

原文链接:
https://doi.org/10.3390/insects14010076

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