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Affymetrix芯片分析：获取差异表达基因系列三——SAM: 王佳 2015-4-11 15:23; source(http://bioconductor.org/biocLite.R) biocLite(ArrayExpress) library(ArrayExpress) AEset-ArrayExpress(E-GEOD-470)% GEO中哮喘相关的基因表达谱数据（编号 GSE470） save(AEset,file=AEset.RData) load(AEset.RData) class(AEset)%三种查看方式 AEset pData(AEs ...; 6032 次阅读|没有评论

Affymetrix芯片分析：获取差异表达基因系列二: 热度 1 王佳 2015-4-11 14:13; library(limma)%把limma包载入R中 library(tcltk)%把tcltk包载入R中 library(affy)%把affy包载入R包中 filters - matrix(c(CEL file, . , All, .*), ncol = 2, byrow = T)%生成2*2字符矩阵，用来定义选择文件类型 cel.files -tk_choose.files(caption = Select CELs, multi ...; 4721 次阅读|1 个评论热度 1

Affymetrix芯片分析：获取差异表达基因系列一: 王佳 2015-4-11 13:35; 实验思路：程序代码及运行结果： library (affy)%把affy包载入R中 library (tcltk)%把tcltk包载入R中 filters - matrix ( c ( CEL file , . , All , .* ), ncol = 2 , byrow = T)%生成2*2字符矩阵，用来定义选择文件类型 cel.files - tk_choose.files ( ...; 6706 次阅读|没有评论

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