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R| 遗传评估| 序列编辑| 其它|

晒书: 郭军 2022-4-23 22:49; 今天是世界读书日，近期购买了几本英文书籍，立个flag，年底前读完！; 1548 次阅读|没有评论

解决Rstudio中文乱码问题: 郭军 2021-5-23 18:40; 最近更新了Rstudio，发现新版本无法正常显示、处理csv文件中文字符。网上寻找解决方法，无果。后来，将csv文件转换成xls或xlsx文件。从file导入后，可以正常显示、处理了。请注意，文件夹以及文件名不能使用中文。对应的script如下： library(readxl) eggquality - read_excel(eggquality.xls) Vie ...; 个人分类: R|3666 次阅读|没有评论

Endnote使用小技巧：如何导入ISI引用次数: 郭军 2021-4-6 20:20; Web of Science对科研人员很贴心，不仅提供期刊影响因子，还可以查到文献被引次数（Times of Cited）。引用次数越多，文献参考价值越大。今天下午，我准备写一篇GWAS综述。首先，我在Web of Science查找参考文献，将其导入endnote后，发现无法显示引用次数。立马上必应和谷歌寻找解决办法。照着网上的方法，部分文献成功 ...; 个人分类: 其它|4301 次阅读|没有评论

Endnote小技巧: 郭军 2020-5-26 20:08; 我喜欢网盘，尤其喜欢它的同步功能，再也不用背着笔记本或揣着闪盘上班了。如果文件夹没能及时同步，也会给工作带了麻烦。这不，今天出现endnote文件夹没能同步，有的参考文献属于travel libaray。如何将travel library的文献挑出了？见下图. 麻烦有时也是好事，给你一次学习机会：-）; 个人分类: 其它|2266 次阅读|没有评论

Endnote:在 (author,year）与author（year）之间自由转换: 郭军 2017-11-24 10:03; 好久没发博文了，今天来除草写文章时，如果主语是引用文献作者，期刊编辑一般要求是作者（年）格式，如“ Ragognetti etal. (2015 ) found that the heritability of tibia length was .....而不是“ Ragognetti et al. found that the heritability 。。。(Ragognetti et al. 2015) ”。问题是 ...; 个人分类: 其它|4922 次阅读|没有评论

计算蛋总重: 郭军 2017-1-19 14:29; 计算蛋总重(egg mass)是一项耗时费力的工作，需要每周平均蛋重(egg weight or egg size)乘以周产蛋数，然后累加。本文介绍两个小技巧，用于蛋总重计算。 1. 内插法补齐缺失记录，或者预测新插点数值。完美生产记录可遇而不可求。有的个体缺失蛋重记录，有时缺少整周蛋重记录。对于这些只有产蛋记录的个体，可 ...; 个人分类: 遗传评估|3923 次阅读|没有评论

修复ubuntu系统不识别U盘: 郭军 2016-12-22 12:57; 重装linux系统之后，意想不到的事情接连发生，真是按倒葫芦又起瓢！这不，ubuntu不识别我的U盘。问过度娘后，应该是U盘没有自动挂载，但是dev和usr都没有sdb文件夹。经过一番摸索后，找到解决办法：就是重启系统时，选择ubuntu高级选项，通过recovery model修复系统！; 个人分类: 其它|6477 次阅读|没有评论

畜禽遗传评估(3)显性遗传效应: 郭军 2016-11-21 20:59; 剖分显性遗传效应的意义在于：A.准确估计遗传力。部分显性遗传效应混杂于加性遗传方差之中，影响遗传参数估计及育种值排序。B. 利于配套系选育。如果性状的显性效应利于产品升值，比如蛋鸡的蛋重，可以放在父系选育。这样，不仅节约生产成本，商品代蛋重也得到改善。畜禽育种规划传统方法通常只考虑加性遗传效应，因为加 ...; 个人分类: 遗传评估|3748 次阅读|没有评论

利用plink转换AGCT为1234: 郭军 2016-11-19 11:49; 我的博文主要是分享一些数据处理技巧，并非真正的知识。等到有了大块时间，再与大家共享值得记忆的知识。做GWAS分析时，多需要haploview 获取linkage disequilibrium参数。这是一项烦躁的工作，需要将AGCT逐个替换成1234。偶然间，发现plink有一个命令可以直接转换输出序列为1234格式。这个命令就是【--allele1 ...; 个人分类: 序列编辑|3164 次阅读|没有评论

Genbank 批量查找snp信息: 郭军 2016-10-31 14:39; 最近忙于GWAS结果整理，茶饭吃起来都不香。屋漏偏逢连夜雨，Genbank偏偏把鸡基因组数据更新到5.0，要知道 Affymetrix给我的可是4.0版数据。为了方便读者，我的文章应提供基于5.0版的结果。好在我利用半天时间找到ncbi提供的批量转换snp入口： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/batchquery.html 页面最下端不显 ...; 个人分类: 序列编辑|4386 次阅读|没有评论

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