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- Dr James Gibbons MVB PhD
UCD School of Veterinary Medicine
http://www.ucd.ie/vetmed/staff/herdhealthanimalhusbandry/jamesgibbons/
Gibbons JF, Boland F, Buckley JF, Butler F, Egan J, Fanning S, Markey BK, Leonard FC. (2014) 'Patterns of antimicrobial resistance in pathogenic Escherichia coli isolates from cases of calf enteritis during the spring-calving season'. Veterinary Microbiology, . [Details]
- JANEWANGJK55
- UCD's Professor Des Higgins
http://www.ucd.ie/news/2014/10OCT14/301014-Professor-Des-Higgins-of-UCD-in-Natures-Top-10-most-highly-cited-research-publications-of-all-time.html\
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC308517/pdf/nar00046-0131.pdf
CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive
multiple sequence alignment through sequence weighting,
position-specific gap penalties and weight matrix choice
Nucleic Acids Res. 1997 Dec 15;25(24):4876-82.
The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools.
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- http://cvm.cau.edu.cn/art/2011/12/26/art_16970_26.html
http://www.cauvet.com/tm/details/index.aspx?nodeid=12&page=ContentPage&contentid=608
韩博 博士，现任中国农业大学动物医学院国家重点学科临床兽医学的教授，博士生导师。执业兽医师，国家博士后基金评审委员，农业部兽药评审专家,世界牛病学会观察员
shea
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- 上海交通大学陆伯勋食品安全研究中心
地址：上海市闵行区东川路800号上海交通大学农业与生物学院2区103室
http://www.foodluh.org/about.asp?id=1105
Shea
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- http://www.cfsa.net.cn/Article/PersonInfo.aspx?id=BDFDD37226736F75D591524025EEC1EF2B70B6B0B5B21DCE
李凤琴
博士，研究员，博士生导师，国家食品安全风险评估中心微生物实验部主任
CFSA 国家食品安全风险评估中心
stx-PCR方法、Vero细胞毒性试验和酶联免疫试剂盒3种方法检测产志贺毒素大肠埃希菌的评估
白莉;胡豫杰;王佳慧;吴青;赫英英;王伟;甘辛;韩春卉;李凤琴;徐进
2014年05期 797-804 页
中国食源性和猪源性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌遗传特性和耐药特征分析
王伟;郭云昌;裴晓燕;胡豫杰;白莉;孙爱萍;刘继开;付萍;李凤琴
2013年06期 925-931 页
2005-2007年中国食品中大肠埃希菌O157亚碲酸钾抗性基因簇的分布和抗性水平的研究
白莉;董银苹;郭云昌
2011年03期 287-289 页
2005～2007年中国食品中疑似O157大肠埃希菌的鉴定及毒素基因的检测
白莉;刘秀梅;付萍;郭云昌
2010年03期 335-338 页
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- http://www2.warwick.ac.uk/fac/med/staff/zzhou/
Dr Zhemin Zhou
University of Warwick .... Cork..... E.coli.....Bioinformatics .....
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- http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2015.00602/full?utm_source=newsletter&utm_medium=email&utm_campaign=Microbiology-w29-2015
http://www.yaofen.com/node/10413
袁宗辉，男，1958年2月生，教授，博士生导师，华中农业大学教授。
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- http://www.sninfo.gov.cn:8083/getDetailByBelongsName.do?method=getDetailByBelongsName&articleId=90850&type=bszn
2016年自然科学基础研究计划项目申报指南
（一）项目类别
主要包括：面上项目、青年人才项目、重点项目。
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- http://www.ucd.ie/research/people/biomolecularbiomedscience/drpeadarogaora/
Dr Peadar O Gaora
School Of Biomolecular & Biomed Science
Conway Institute
Belfield
Dublin 4
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- http://renzheng.cscse.edu.cn/Login.aspx
国外学历学位 认证系统
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- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/submit_beta_lactamase/
Beta Lactamase Submissions
The spread of beta-lactamases, which confer resistance to beta-lactam antibiotics, is a serious clinical and public health problem. Genotypic and functional characterization of beta-lactamases is critical. The curation of many of these medically-important enzymes has in the past been performed solely by Drs. Karen Bush, George Jacoby, and Timothy Palzkill and has been hosted at the Lahey Clinic. After discussion with the above experts NCBI has agreed to host the data to ensure the long-term stability of this important resource which will include:
The storage of current beta-lactamase alleles (the specific nucleotide and protein accessions associated with each allele) along with links to any publication when available.
The curation (assignment of) new beta-lactamase alleles.
Enabling the retrieval of beta-lactamase nucleotide and protein accessions along with the antibiotic susceptibility profile of a transconjugant/transformant bearing the beta-lactamase gene(s).
Currently, the Lahey db curates beta-lactamase enzymes belonging to the following families: ACC, ACT, BEL, CARB, CFE, CMY, CTX-M, DHA, FOX, GES, GIM, KPC, IMI, IMP, IND, LAT, MIR, MOX, NDM, OXA, PER, SHV, SME, TEM, VEB, and VIM. Another web site for TEM, SHV, and class B enzymes can be found at http://www.laced.uni-stuttgart.de. A web site for LEN, OXY,
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- 信息工程学院青年教师学术交流通知————数据挖掘与大数据处理
文章来源： 文章来源：研究生办
报告1：生物数据分析中的数据挖掘方法
报告人：于建涛
报告内容：计算生物学是分子生物学与信息科学、统计学相结合发展的新兴学科。如何开发适合解决特定生物问题的计算方法是计算生物学家的主要任务。本报告将围绕蛋白质相互作用预测、下一代测序数据分析等问题，阐述其中所涉及到的数据挖掘方法、统计学方法等，并讨论这些计算方法如何更好地为解决特定的生物问题而服务。
报告2：蛋白质复合物监督聚类挖掘方法研究
报告人：刘全中
报告内容：蛋白质复合物表示一组高度交互、相互调控、相互作用的蛋白质，它不仅可以用来预测蛋白质功能、疾病基因以及基因的突变，而且能帮助我们理解和解释特定的生物学变化过程。近年来，实验产生了大量的不同物种的蛋白质互作网络数据集，蛋白质相互作用网络可以模拟为一种图结构，其中蛋白质表示图的结点，蛋白质之间的交互表示图的边。一个蛋白质复合物对应蛋白质相互作用网络中一个连通子图，近年来研究界提出了很多挖掘蛋白质复合物算法，绝大部分的算法是一种非监督的聚类算法，这些算法共同的核心思想源于蛋白质是一个稠密的连通子图，设计特定的聚类标准试图搜索稠密连通子图以挖掘蛋白质复合物。但是，常规的聚类算法忽略了蛋白质子图固有的特性，本报告针对此问题，探讨一种监督聚类算法，整合蛋白质复合物子图固有的特征，设计新的监督聚类算法更好的解决常规聚类算法存在问题。
报告3：高通量数据的特征选择
报告人：耿耀君
报告内容：随着高通量检测技术的不断进步，在生命科学领域，基因表达数据，单核苷酸多态性（SNP）数据等高通量数据不断涌现。这些数据为我们从多种层面去认识疾病发生的机理，同一物种不同种群间的差异等问题提供了详细的资料。但是这些数据中基因或SNP的个数远远超过了样本的个数，如何在成千上万个基因或SNP中找出与疾病相关的基因和SNP是非常迫切需要解决的问题。报告将介绍两种解决此问题的方法。
报告4：Analysis of retained introns in Arabidopsis using machine learning methods
报告人：毛锐
报告内容：One of the important modes of pre-mRNA post-transcriptional modification is alternative splicing. Alternative splicing allows creation of many distinct mature mRNA transcripts from a single gene by utilizing different splice sites. In plants like Arabidopsis thaliana, the most common type of alternative splicing is intron retention. Many studies in the past focus on positional distribution of retained introns (RIs) among different genic regions and their expression regulations, while little systematic classification of RIs from constitutively spliced introns (CSIs) has been conducted using machine learning approaches. We used random forest and support vector machine (SVM) with radial basis kernel function (RBF) to differentiate these two types of introns in Arabidopsis.
报告5：生物网络模式数据发现算法
报告人：赵建邦
报告内容：代谢网络以模块化方式实现系统功能，特定功能的模块在拓扑上相对保守，存在于不同物种的代谢网络中。本报告将围绕代谢网络数据进行模式挖掘，包括模体以及功能模块的搜索问题。并探讨动态数据模式识别及其在代谢网络上的应用。
报告时间：10月30日 下午14:10
报告地点：信息工程学院二楼副203报告厅
报告人简介：
于建涛，工学博士，研究方向为机器学习方法与生物信息学。2011年7月获哈尔滨工业大学人工智能与信息处理专业博士学位，2011年12月至2014年7月在美国内布拉斯加-林肯大学植物科学创新中心从事下一代测序数据分析的博士后研究工作。在Bioinformatics（SCI影响因子5.3）、电子学报等国内外较高水平期刊上发表文章，参与过美国比尔盖茨基金等国内外重点科研项目，具有较强的交叉学科背景知识。
刘全中，博士。研究方向：数据挖掘、生物信息。在基因表达谱分类、信息基因选择、疾病相关的基因表达模式挖掘方面发表学术论文7篇。
耿耀君，工学博士，2013年3月毕业于西安电子科技大学，计算机应用技术专业。 研究方向：模式识别，基因选择。
毛锐，女，陕西三原人。硕士研究生毕业于西安交通大学软件工程专业，现任西北农林科技大学信息工程学院讲师，在职博士。主要研究方向：数据挖掘方法在生物信息中的应用；可变剪切序列和结构的特征分析；自动化测试平台和工具
赵建邦，2011年12月毕业于西安电子科技大学计算机应用专业，获工学博士学位。主要的研究方向是：复杂网络模式数据挖掘、系统发生分析。
整理日期：2014-10-29 10:09:23
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- 柴同杰 山东农业大学 动物科学学院 动物医学院
http://dkdy.sdau.edu.cn/s/42/t/586/5b/17/info23319.htm
简介：柴同杰，博士，教授，硕士\博士生导师，获得德国柏林大学动物医学博士学位，山东农业大学‘1512’人才工程第一层次教授，动物科技与动物医学院教授委员会副主任。兼任国家兽医教育委员会委员、中华预防医学会空气微生物学专业委员会副主任、中国动物微生态学会副理事长、中国家兔产业技术创新联盟技术委员会首席专家、山东省中德动物疫源人兽共患传染病合作研究中心主任、山东畜禽健康养殖与福利学会理事长、世界宠物协会高级专家顾问团副主任委员、世界动物卫生学会ISAH委员、欧美同学会会员、德国工程师学会VDI海外理事，担任《VeterinaryMedicine：ResearchandReport》、《IndoorAir》、《VeterinaryMicrobiology》、《AmericanJournalofEpidemiology》、《AfricanJournalofMicrobiologyResearch》、《JOURNALOFMEDIAANDCOMMUNICATIONSTUDIES》、《中国病毒病杂志》等14种学术刊物的编委和审稿专家等学术兼职。
多年来担任国务院学位办、科技部国际合作司、国家博士后流动站管理部、科技论文在线、扬州大学、中国农科院、甘肃省、河北省、安徽省等聘任的博士学位授权点、科技项目、奖励、论文、博士生导师遴选评审专家。
研究领域：动物病原微生物学、兽医免疫学、畜禽传染病学、动物环境卫生与动物福利学、动物微生态学。
- JANEWANGJK55
- 副秘书长：韦良孟博士 2015/11/16 19:40:43 新闻来源：动物福利与健康养殖分会
韦良孟，男，1984年3月生，山东泰安人，博士，讲师。2013年6月获华南农业大学预防兽医学博士学位，同年7月进入山东农业大学动物科技学院工作，并担任柴同杰教授的科研助理。给本科生讲授《兽医微生物学》、《兽医微生物学实验》及《动物微生物学及检验技术实验》等课程。博士期间主要从事H5N1亚型高致病性禽流感病毒感染水禽后与宿主天然免疫相互作用机理的研究，发表文章10余篇，其中6篇被SCI收录。相关学术论文发表在《Journal of virology》、《Veterinary Microbiology》、《Veterinary Immunology and Immunopathology》和《Poultry Science》等杂志。
E-mail：lmwei@sdau.edu.cn，weiliangmeng04@163.com
Cell：(+86) 15253858899
- JANEWANGJK55
- http://www.monash.edu.au/pharm/research/researchers/profile.html?sid=4621&pid=3646&sa=U&ei=oThRU7f2N4OjyATItIHwCg&ved=0CFUQFjAO&usg=AFQjCNHctV08wZXFw0EJKRgDZGGGeAIJDA
Jian Li
Biography
Position
NHMRC Senior Research Fellow
Drug Delivery, Disposition and Dynamics
Monash Institute of Pharmaceutical Sciences
The last line of defence
Professor Jian Li represents one of medical science's last defences against the ongoing march of the bacterial andlsquo;superbugs'. He is a world leader in the pharmacology of polymyxin, one of the few antibiotics currently available that is still capable of successfully fighting bacteria which have become resistant to just about every other antibiotic on the market.
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