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IP: 113.200.245.*   JANEWANGJK55 发表了评论   2016-8-23 11:07
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/submit_beta_lactamase/
ESBL database!
IP: 113.200.245.*   JANEWANGJK55 发表了评论   2016-8-23 11:09
>gi|126013667|gb|EF418608.1| Escherichia coli extended-spectrum beta-lactamase CTX-M-65 (blaCTX-M-65) gene, complete cds
GAGTTTGAGATGGTGACAAAGAGAGTGCAACGGATGATGTTCGCGGCGGCGGCGTGCATTCCGCTGCTGC
TGGGCAGCGCGCCGCTTTATGCGCAGACGAGTGCGGTGCAGCAAAAGCTGGCGGCGCTGGAGAAAAGCAG
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IP: 113.200.245.*   JANEWANGJK55 发表了评论   2016-8-23 11:09
>gi|126013667|gb|EF418608.1| Escherichia coli extended-spectrum beta-lactamase CTX-M-65 (blaCTX-M-65) gene, complete cds
GAGTTTGAGATGGTGACAAAGAGAGTGCAACGGATGATGTTCGCGGCGGCGGCGTGCATTCCGCTGCTGC
TGGGCAGCGCGCCGCTTTATGCGCAGACGAGTGCGGTGCAGCAAAAGCTGGCGGCGCTGGAGAAAAGCAG
CGGAGGGCGGCTGGGCGTCGCGCTCATCGATACCGCAGATAATACGCAGGTGCTTTATCGCGGTGATGAA
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GATGTGCTGGCTTCAGCGGCGAGAATCATCGCCGAAGGGCTGTAAACTGG
IP: 124.115.66.*   JANEWANGJK55 发表了评论   2016-9-1 17:51
>gi|154425490|dbj|AB284167.2| Shigella sonnei plasmid pfmcSS blaCTX-M-64 gene for cefotaximase, complete cds
TTGCTCTGTGGATAACTTGCAGAGTTTATTAAGTATCATTGCAGCAAAGATGAAATCAATGATTTATCAA
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IP: 124.115.66.*   JANEWANGJK55 发表了评论   2016-9-1 18:08
CTX-M-type ß-Lactamases

Group 2be
ß-Lactamase        Nucleotide        Reference
CTX-M-1        X92506        AAC40:509, 1996
CTX-M-2        X92507        AAC40:509, 1996
CTX-M-3        Y10278        AAC42:827, 1998
CTX-M-4        Y14156        AAC42:1259, 1998
CTX-M-5        U95364        AAC42:1980, 1998
CTX-M-6        AJ005044        FEMS Micro Lett. 165:289, 1998
CTX-M-7        AJ005045        FEMS Micro Lett. 165:289, 1998
CTX-M-8        AF189721        AAC44:1936, 2000
CTX-M-9        AF174129        AAC44:1970, 2000
CTX-M-10        AF255298        AAC45:616, 2001
CTX-M-11        AY005110         
CTX-M-12        AF305837        AAC45:2141, 2001
CTX-M-13        AF252623        AAC 46:630, 2002
CTX-M-14        AF252622        AAC 46:630, 2002
CTX-M-15 (UOE-1)        AY044436        FEMS Microbiol. Lett. 201:237, 2001
CTX-M-16        AY029068        AAC 45:2269, 2001
CTX-M-17        AY033516        AAC 46:1212, 2002
CTX-M-18        AF325133        AAC 45:3355, 2001
CTX-M-19        AF325134        AAC 45:3355, 2001
CTX-M-20        AJ416344        FEMS Microbiol. Lett. 209:161, 2002
CTX-M-21        AJ416346        FEMS Microbiol. Lett. 209:161, 2002
CTX-M-22        AY080894        J. Infect. 54:53, 2007
CTX-M-23        AF488377        JAC 54:406, 2004
CTX-M-24        AY143430        JAC 57:14-23, 2006
CTX-M-25        AF518567        AAC 48:4829, 2004
CTX-M-26        AY157676        JAC 51:195, 2003
CTX-M-27        AY156923        JAC 52:29, 2003
CTX-M-28        AJ549244        JAC 56:115-121, 2005
CTX-M-29        AY267213        J. Infect. 54:53, 2007
CTX-M-30        AY292654        AAC 48:4435, 2004
CTX-M-31        AJ567481        AAC 47:2864, 2003
CTX-M-32        AJ557142        AAC 48:2308, 2004
CTX-M-33        AY238472        Int. J. Antimicrob. Agents 29: 598-600, 2007
CTX-M-34        AY515297        JAC 56:1152, 2005
CTX-M-35        Assigned         
CTX-M-36        AB177384         
CTX-M-37        AY649755        Int. J. Antimicrob. Agents 28:288-291, 2006
CTX-M-38        AY822595        Chin. J. Infect. Chemother. 9:216-218, 2009
CTX-M-39        AY954516        AAC49:4745,2005
CTX-M-40        AY750914        Int. J. Antimicrob. Agents 27:572, 2006
CTX-M-41        DQ023162        JAC 62:289-295, 2008
CTX-M-42        DQ061159        AAC 52:1297-1301, 2008
CTX-M-43        DQ102702        JAC 57:975, 2006
CTX-M-44 (Toho-1)        D37830        AAC 39: 2269, 1995
CTX-M-45 (Toho-2)        D89862        AAC 42: 1181, 1998
CTX-M-46        AY847147        JCM 43:4301, 2005
CTX-M-47        AY847143        JCM 43: 4301, 2005 (renumbered)
CTX-M-48        AY847144        JCM 43: 4301, 2005 (renumbered)
CTX-M-49        AY847145        JCM 43: 4301, 2005 (renumbered)
CTX-M-50        AY847146        JCM 43: 4301, 2005 (renumbered)
CTX-M-51        DQ211987         
CTX-M-52        DQ223685         
CTX-M-53        DQ268764        AAC 53: 1944-1951, 2009
CTX-M-54        DQ303459        JAC 58:315, 2006
CTX-M-55        DQ885477        Diag. Microbiol. Infect Dis. 58:349, 2007
CTX-M-56        EF374097        AAC 51:2720-2725, 2007
CTX-M-57        DQ810789        Int. J. Antimicrob. Agents 31:85-86, 2008
CTX-M-58        EF210159         
CTX-M-59        DQ408762        AAC 52:1790-1793, 2008
CTX-M-60        AM411407         
CTX-M-61        EF219142        JAC 60:956-964, 2007
CTX-M-62        EF219134        AAC 52:4198-4202, 2008
CTX-M-63        AB205197         
CTX-M-64        AB284167        AAC 53: 69-74, 2009
CTX-M-65        EF418608        AAC 52:1204-1205, 2008
CTX-M-66        EF576988        Diag. Microbiol Inf. Dis. 60:169-175, 2008
CTX-M-67        EF581888        Int. J. Antimicrob. Agents 32: 534-537, 2008
CTX-M-68        EU177100        Int. J. Antimicrob. Agents 34: 544-549, 2009
CTX-M-69        EU402393        J. Med. Microbiol. 61:233-238, 2012
CTX-M-70        Assigned         
CTX-M-71        FJ815436        AAC 53: 4518-4521, 2009
CTX-M-72        AY847148        J. Gen. Appl. Microbiol. 55: 207-216, 2009
CTX-M-73        Assigned         
CTX-M-74        GQ149243        Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 65: 202-206, 2009
CTX-M-75        GQ149244        Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 65: 202-206, 2009
CTX-M-76        AM982520         
CTX-M-77        AM982521         
CTX-M-78        AM982522        AAC 54: 3070-3071, 2010
CTX-M-79        EF426798        Can. J. Microbiol. 54: 781-785, 2008
CTX-M-80        EU202673         
CTX-M-81        EU136031         
CTX-M-82        DQ256091        JAC 63:895-900, 2009
CTX-M-83        FJ214366        JAC 63:87-94, 2009
CTX-M-84        FJ214367        JAC 63:87-94, 2009
CTX-M-85        FJ214368        JAC 63:87-94, 2009
CTX-M-86        FJ214369        JAC 63:87-94, 2009
CTX-M-87        EU545409        J. Med. Microbiol. 58: 811-815, 2009
CTX-M-88        FJ873739         
CTX-M-89        FJ971899        JCM 47:2970-2974, 2009
CTX-M-90        FJ907381         
CTX-M-91        GQ870432         
CTX-M-92        GU127598         
CTX-M-93        HQ166709        AAC 55:1861-1866, 2011
CTX-M-94        HM167760        PLoS One 7:e46329
CTX-M-95        FN813245         
CTX-M-96        AJ704396         
CTX-M-97        HM776707        Eur J Clin Microbiol Infect Dis (Nov2) 2012
CTX-M-98        HM755448         
CTX-M-99        HM803271         
CTX-M-100        FR682582        PLoS One 7:e46329
CTX-M-101        HQ398214         
CTX-M-102        HQ398215         
CTX-M-103        HG423149         
CTX-M-104        HQ833652         
CTX-M-105        HQ833651         
CTX-M-106        HQ913565         
CTX-M-107        JF274244         
CTX-M-108        JF274245         
CTX-M-109        JF274248         
CTX-M-110        JF274242         
CTX-M-111        JF274243         
CTX-M-112        JF274246         
CTX-M-113        JF274247         
CTX-M-114        GQ351346         
CTX-M-115        KJ911020

CTX-M-116        JF966749        AAC 57: 1552-1555, 2013
CTX-M-117        JN227085        Int. J. Antimicrob. Agents 41: 94-95, 2013
CTX-M-118        Withdrawn         
CTX-M-119        Assigned         
CTX-M-120        Assigned         
CTX-M-121        JN790862

CTX-M-122        JN790863

CTX-M-123        JN790864
AAC 57: 4068-4071, 2013
CTX-M-124        JQ429324        AAC 56:2756-2758, 2012
CTX-M-125        JQ724542         
CTX-M-126        AB703103         
CTX-M-127        Assigned         
CTX-M-128        Assigned         
CTX-M-129        JX017364         
CTX-M-130        JX017365         
CTX-M-131        JN969893        AAC 59:1815-1817, 2015
CTX-M-132        JX313020        AAC 59:5976-83, 2015
CTX-M-133        AB185834         
CTX-M-134        JX896165         
CTX-M-135        Assigned         
CTX-M-136        KC351754         
CTX-M-137        AB900900        JAC 69:2081-2085, 2014
CTX-M-138        Assigned         
CTX-M-139        KC107824         
CTX-M-140        Assigned         
CTX-M-141        KC964871         
CTX-M-142        KF240809

CTX-M-143        Assigned         
CTX-M-144        KJ020573         
CTX-M-145        Assigned         
CTX-M-146        Assigned         
CTX-M-147        KF513180         
CTX-M-148        KJ020574         
CTX-M-149        Withdrawn         
CTX-M-150        KF769131         
CTX-M-151        AB916359         
CTX-M-152        KJ461948         
CTX-M-153        Assigned         
CTX-M-154        Assigned         
CTX-M-155        KM211508         
CTX-M-156        KM211509         
CTX-M-157        KM211510         
CTX-M-158        KM211691         
CTX-M-159        AB976602

CTX-M-160        KP050493         
CTX-M-161        KP128034         
CTX-M-162        KP681697         
CTX-M-163        KP681698         
CTX-M-164        KP727571         
CTX-M-165        KP727572         
CTX-M-166        Assigned         
CTX-M-167        Assigned         
CTX-M-168        Assigned         
CTX-M-169        KR779864         
CTX-M-170        KR822223         
CTX-M-171        KT277545         
CTX-M-172        KT251041         


Note: the amino acid sequences of CTX-M-14 and CTX-M-18, CTX-M-55 and CTX-M-57, CTX-M-2 and CTX-M-97, and CTX-M-3 and CTX-M-133 are identical.
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http://www.lahey.org/Studies/other.asp#table1
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CTX-M-79:
Escherichia coli strain T24 extended-spectrum beta-lactamase gene, complete cds
GenBank: EF426798.1
GenBank Graphics
>gi|126256517|gb|EF426798.1| Escherichia coli strain T24 extended-spectrum beta-lactamase gene, complete cds
ATGGTTAAAAAATCACTGCGCCAGTTCACGCTGATGGCGACGGCAACCGTCACGCTGTTGTTAGGAAGTG
TGCCGCTGTATGCGCAAACGGCGGACGTACAGCAAAAACTTGCCGAATTAGAGCGGCAGTCGGGAGGCAG
ACTGGGTGTGGCATTGATTAACACAGCAGATAATTCGCAAATACTTTATCGTGCTGATGAGCGCTTTGCG
ATGTGCAGCACCAGTAAAGTGATGGCCGTGGCCGCGGTGCTGAAGAAAAGTGAAAGCGAACCGAATCTGT
TAAATCAGCGAGTTGAGATCAAAAAATCTGACCTTGTTAACTATAATCCGATTGCGGAAAAGCACGTCAA
TGGGACGATGTCACTGGCTGAGCTTAGCGCGGCCGCGCTACAGTACAGCGATAACGTGGCGATGAATAAG
CTGATTGCTCACGTTGGCGGCCCGGCTAGCGTCACCGCGTTCGCCCGACAGCTGGGAGACGAAACGTTCC
GTCTCGACCGTACCGAGCCGACGTTAAACACCGCCATTCCGGGCGATCCGCGTGATACCACTTCACCTCG
GGCAATGGCGCAAACTCTGCGGAATCTGACGCTGGGTAAAGCATTGGGCGACAGCCAACGGGCGCAGCTG
GTGACATGGATGAAAGGCAATACCACCGGTGCAGCGAGCATTCAGGCTGGACTGCCTGCTTCCTGGGTTG
TGGGGGATAAAACCGGCAGCGGTGGCTATGGCACCACCAACGATATCGCGGTGATCTGGCCAAAAGATCG
TGCGCCGCTGATTCTGGTCACTTACTTCACCCAGCCTCAACCTAAGGCAGAAAGCCGTCGCGATGTATTA
GCGTCGGCGGCTAAAATCGTCACCAACGGTTTGTAA

REVERSE--
TTACAAACCGTTGGTGACGATTTTAGCCGCCGACGCTAATACATCGCGACGGCTTTCTGCCTTAGGTTGAGGCTGGGTGAAGTAAGTGACCAGAATCAGCGGCGCACGATCTTTTGGCCAGATCACCGCGATATCGTTGGTGGTGCCATAGCCACCGCTGCCGGTTTTATCCCCCACAACCCAGGAAGCAGGCAGTCCAGCCTGAATGCTCGCTGCACCGGTGGTATTGCCTTTCATCCATGTCACCAGCTGCGCCCGTTGGCTGTCGCCCAATGCTTTACCCAGCGTCAGATTCCGCAGAGTTTGCGCCATTGCCCGAGGTGAAGTGGTATCACGCGGATCGCCCGGAATGGCGGTGTTTAACGTCGGCTCGGTACGGTCGAGACGGAACGTTTCGTCTCCCAGCTGTCGGGCGAACGCGGTGACGCTAGCCGGGCCGCCAACGTGAGCAATCAGCTTATTCATCGCCACGTTATCGCTGTACTGTAGCGCGGCCGCGCTAAGCTCAGCCAGTGACATCGTCCCATTGACGTGCTTTTCCGCAATCGGATTATAGTTAACAAGGTCAGATTTTTTGATCTCAACTCGCTGATTTAACAGATTCGGTTCGCTTTCACTTTTCTTCAGCACCGCGGCCACGGCCATCACTTTACTGGTGCTGCACATCGCAAAGCGCTCATCAGCACGATAAAGTATTTGCGAATTATCTGCTGTGTTAATCAATGCCACACCCAGTCTGCCTCCCGACTGCCGCTCTAATTCGGCAAGTTTTTGCTGTACGTCCGCCGTTTGCGCATACAGCGGCACACTTCCTAACAACAGCGTGACGGTTGCCGTCGCCATCAGCGTGAACTGGCGCAGTGATTTTTTAACCAT

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GMT+8, 2024-5-1 12:54

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