tanklao的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/tanklao

博文

TCID50的计算

已有 34490 次阅读 2012-12-6 08:36 |个人分类:微生物学|系统分类:科研笔记| TCID50, 病毒滴度

TCID50的计算一般是参考这个网站来进行的,但是这个网站提供的方法讲的不够具体,本文试图对TCID50的计算做进一步的说明,希望对刚入们同行有所帮助,如有不对,还请多多指教。

TCID50 是指组织培养物(细胞)半数致死剂量。它有几个性质我们必须明白:1)它表示的是计量,不是浓度; 2)它是一个单位;3)它的值等于1,实际上问它的值等于多少是一个没有意义的问题,就像问km的值等于多少一样,如果非要说出的的值等于多少,那我们只能说它的值在任何情况下都等于1。理解这三个性质对于理解TCID50非常重要,但是这三个性质经常被误解,所以导致对TCID50的理解出现偏差。

首先我们来看一下这个表示法的意思:

病毒滴度为108.2TCID50/ml 
它表示的是每ml病毒溶液里含有108.2个TCID50的病毒,这和氯化钠的浓度为4.5mol/L表示每L溶液中含有4.5个mol的氯化钠是一样的道理。

经常可以听到人说我的病毒的TCID50是10x.x。这个说法是不科学的,应该说我这个溶液里含有10x.x个TCID50的病毒或者说我这个溶液的病毒滴度是10xxTCID50/ml。也可以说病毒的TCID50效价是10-x.x

理解了TCID50的概念之后,我们再来看看TCID50是如何计算的?

请看例子
http://img.dxy.cn/upload/2009/04/08/88720506.snap.jpg
http://docs.google.com/File?id=dhktmnk8_117kwp3kgft_b
图中给出的计算方法是有问题的,请先忽略不看。

从图中我们可以知道半数致死的稀释度肯定是介于10-6到10-7之间,肯定可以表示成10-6.xx。那么这个.xx到到底是多少呢?
这实际上是一个线性插值的问题。求解见下图:
http://docs.google.com/File?id=dhktmnk8_119f2vpmncj_b
根据平面解析几何知识可知:
PD/[log(dilution above 50%)-log(dilution below 50%)]=[(%next above 50%)-50%]/[(%next above 50%)-(%next below 50%)]
*注意:如果你的病毒是以3倍3倍地稀释那么上面这个公式的log就应该改为是以3为底的对数(即log3),其他稀释度与此相类似。
在本例子中
PD/[(-6)-(-7)]=(80%-50%)/(80%-0%)
PD=0.375
log(50%的致死的稀释度)=-6-0.375=-6.375
求解得到50%的致死的稀释度为10-6.375

根据TCID50的定义,就把在这个稀释度的总体溶液中所含有的病毒的量定义为1个TCID50.
在本例中即把病毒稀释到10-6.375梯度后取0.200ml所含有的病毒的量定义为1个TCID50.

接下来我们就可以根据这个定义来求原液的病毒滴度。通常求解每ml含有多少个TCID50的病毒。
我们先要来求解这个问题:已知取0.008ml病毒原液稀释到10-6.375梯度后(即稀释106.375倍后)取0.200ml所含的病毒的量为1个TCID50,那么病毒原液直接取0.008ml有多少个TCID50.
如果把0.008ml稀释106.375倍后,总共可以得到0.008 x 106.375 ml稀释液,取0.200ml这样的稀释液含有1个TCID50.

所以这0.008ml的病毒原液含有
0.008 x 106.375 ml*1TCID50/0.200ml=0.008* 106.375 *5TCID50=0.004* 107.375TCID50

再求解1ml有多少个TCID50就简单了:
设1ml这样的病毒原液就有x个TCID50
x/1ml=0.004* 107.375/0.008ml
x=0.5*107.375=1.185*107
所以每ml这样的病毒原液有1.185*107个TCID50,即该病毒原液的滴度为1.185*107TCID50/ml

Tag:TCID50计算方法, 100TCID50,病毒滴度

http://www.dxy.cn/bbs/topic/14324310




https://blog.sciencenet.cn/blog-53145-639665.html

上一篇:如何用perl处理测序文件
下一篇:桂花飘香
收藏 IP: 134.68.58.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-20 06:37

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部