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研究发现(艾滋病)病毒与计算机网络感染类似并警示应及早治疗

已有 3269 次阅读 2015-4-9 04:28 |系统分类:论文交流| 文章, 计算机网络, 艾滋病, 蠕虫

我们最新一篇文章:

Zhang C, Zhou S, Groppelli E, Pellegrino P, Williams I, Borrow P, et al. Hybrid Spreading Mechanisms and T Cell Activation Shape the Dynamics of HIV-1 Infection. PLoS Computational Biology. 2015 Apr 2;11(4):e1004179. [WEB|PDF|Program]

被几家影响力广泛的媒体报道。包括英国《卫报》(Guardian)英国《每日邮报》(Daily Mail)《印度时报》(Times of India)《国际财经时报》(International Business Times UK),和科学日报(Science Daily)等。另外还推荐阅读Vice Motherboard写的报道:What Computer Worms Can Tell Us About HIV。以下是对英国《每日邮报》(Daily Mail)报道内容的翻译


       英国《每日邮报》: 研究发现(艾滋病)病毒与计算机网络感染类似并警示及早治疗很关键


       一个新的艾滋病病毒感染模型显示此病毒与一些计算机蠕虫采用相似的传播方式。
       伦敦大学学院研究艾滋病病毒和网络安全的专家们从对病毒传播的模拟中得到的这个发现。
       他们合作建立了一个混合传播的模型。这个模型能够准确预测一个主要临床试验中的病人从感染病毒到发展为艾滋病的时间,并且揭示了及早治疗是防止艾滋病的关键。
       这个研究小组发现,艾滋病病毒在人体内通过两种方式传播:通过血液传播和细胞间直接接触传播。这类似于一些计算机蠕虫为了感染尽可能多的计算机而同时在互联网和局域网间传播。
       这个模型从艾滋病病毒与计算机蠕虫的相似性中得到启示。一个计算机蠕虫的例子是“Conficker”。这个蠕虫在2008年首次被发现,它感染了欧洲的军用和警用网络,并且现在仍处于活跃状态。
       来自伦敦大学学院的第一作者,张长旺说:“艾滋病病毒与(蠕虫)Conficker有很多的相似之处。”
       “他们都采用混合传播方式,都持续很长时间,并且都极难根除。”
       “我们的模型让我们能够解释它们这些重要的特性并预测感染进程。”
       长旺的导师Shi Zhou博士说:“尽管网络安全组织开展了空前的合作来处理(蠕虫)Conficker,最后也没能够把Conficker从互联网上根除”。
       “艾滋病病毒研究者也面临同样的问题。我们希望我们新的对于混合传播的理解能够帮助对抗Conficker和艾滋病病毒”。
       来自伦敦的17个艾滋病病毒感染病人的采样数据被用于检验模型的正确性。结果显示,混合传播提供了艾滋病病毒感染进程的最佳解释并且揭示了及早治疗的好处。
       艾滋病病毒感染CD4+ T 细胞。这种细胞在免疫系统中起关键作用并能够保护人体免于疾病。随着艾滋病病毒感染的发展,体内活跃T细胞数量下降,直到免疫系统不能正常工作。这种状态就是获得性免疫缺陷综合征(AIDS,音译为艾滋病)。
       现行的世界卫生组织(WHO)方针建议只在血液中T细胞数量降低到一定程度的时候才开始艾滋病病毒治疗。英国政府也遵循这个方针。
       然而,这个新的模型预测为了防止最终发展成为艾滋病,治疗应该在感染后及早开始。
       共同资深作者,来自伦敦大学学院的Benny Chain教授说:“艾滋病病毒在血液中的数量总是相对来说比较小的。我们的模型显示艾滋病病毒只通过血液传播并不足够导致艾滋病。”
       “艾滋病病毒有可能在有高浓度T细胞的地方,比如肠道组织,建立据点。从中,它可以很高效的直接在细胞之间传播。”
       同样的,如果艾滋病病毒在治疗开始的时候已经传播到了有大量T细胞聚集的区域,通过防止它在血液中的传播将不能阻止发展成为艾滋病。
       “我们的模型指示完全阻止细胞间的病毒传播能够防止感染发展成为艾滋病。这显示(我们)需要研究新的治疗方案。”
       共同资深作者Clare Jolly博士的实验研究曾经显示,有一些药物对比其他药物具有更好的阻止细胞间直接病毒传播的效果。
       然而,因为细胞间直接病毒传播发生在内脏中,它是无法直接从病人身上测量的。
       Clare Jolly博士说:“通过这个模型,我们应该就能够评估药物对于真实病人体内艾滋病病毒不同传播方式的效力”。
       “这在解读药物试验结果,包括哪一些药物有作用和为什么有作用时的价值可以大到无法衡量。物理学研究中普遍使用计算模型来理解我们无法直接观测的过程和支持很多基本理论。”
       “我们的模型提供了强有力的证据来支持细胞间直接传播是艾滋病病毒传播非常重要的一部分。我们希望在未来的动物实验中直接验证这一结论。”


报道原文:

英国《每日邮报》(Daily Mail) ,HIV spreads like a computer worm: Researchers find virus mimics an online infection - and warn early detection is key,http://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-3023671/HIV-spreads-like-computer-virus-Researchers-spread-mimics-online-infection-warn-early-detection-key.html


下载文章:Zhang et al. - 2015 - Hybrid Spreading Mechanisms and T Cell Activation .pdf


下载文章程序:modelhiv.zip


运行以上程序需要先安装JavaGnuplot 4.6.5 并将Java和Gnuplot命令加入到系统的搜索路径PATH中。


对于Windows系统,也可以直接下载此整合安装包(包括Java+Gnuplot):LeoTaskRunEnv





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