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欧洲科学院院士蒋田仔团队 | 脑成像数据的多模态融合: 方法与应用
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神经成像数据通常包括多种模态，如结构或功能磁共振成像、扩散张量成像和正电子发射断层扫描等，它们为观察和分析大脑提供了多种视角。为了充分利用不同模态的互补表征，我们需要进行多模态融合，以挖掘模态间和模态内的信息。这些丰富的信息，使得结合多种模态数据来探索健康和疾病状态下大脑的结构和功能特征变得越来越流行。
欧洲科学院外籍院士蒋田仔团队首先回顾了融合多模态脑成像数据的各种先进机器学习方法，大致分为无监督学习策略和有监督学习策略。随后讨论了一些具有代表性的应用范式，包括如何帮助理解大脑结构、如何提高认知、行为和脑衰老的预测，以及如何加速大脑疾病的生物标记探索。最后讨论了一些令人兴奋的新兴趋势和重要的未来方向。文章全面概述多模态脑成像融合方法及成功的应用范式，以及多尺度和大数据带来的挑战，这引发了开发新模型和平台的迫切需求。文章已发表于《机器智能研究（英文）》2024年第1期中。
图片来自Springer
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Multimodal Fusion of Brain Imaging Data: Methods and applications
Na Luo, Weiyang Shi, Zhengyi Yang, Ming Song & Tianzi Jiang
https://link.springer.com/article/10.1007/s11633-023-1442-8
https://www.mi-research.net/en/article/doi/10.1007/s11633-023-1442-8
全文导读
神经成像为识别和测量大脑的结构和功能提供了一种手段。不同的非侵入性成像测量可揭示神经系统的不同特征，如组织结构、功能激活或结构和功能连接。磁共振成像(MRI)是最重要的神经成像技术之一，广泛应用于神经科学研究和临床。结构磁共振成像(sMRI)提供有关大脑组织类型的信息。功能磁共振成像(fMRI)动态测量与大脑神经活动相关的血流动力学反应。此外，弥散加权成像(DWI)还能提供大脑区域之间的结构连接信息。通常情况下，这些数据是以单一模式分别进行分析的。最近，使用各种成像技术从同一个人身上收集多种类型的大脑数据已成为普遍做法。与单一模态相比，多种模态的融合可捕捉到跨模态(共享和互补)信息，这种做法有望提供更多有关潜在问题的见解。
数据融合的共同目标是最大限度地挖掘各模态之间共享的联合信息以及各模态内的互补信息。在过去的几十年里，基于学习的融合方法有了长足的进步。根据是否使用标签来指导学习过程，我们将现有的融合技术细分为无监督学习方法和有监督学习方法。有监督学习方法的目标函数非常明显且一致，即学习输入与标签之间的映射，然后通过减少预测标签与真实标签之间的差异来优化联合表征。对于无监督学习策略，我们根据不同的目标函数将其进一步细分为三类：基于相关性的融合、多视角聚类和数据重构。下文将对每一类中的先进方法进行系统介绍。传统的融合方法通常强调最大限度地利用共享表征，而忽略了各个模态内的互补信息。因此，我们也将讨论这些方法在探索互补信息方面的变体。
进行多模态融合分析有利于加深对不同时空尺度复杂大脑网络的理解。首先，脑图谱是研究脑网络的先决条件，在神经科学和临床实践中发挥着核心作用。尽管许多广泛应用的脑图谱主要通过单一模式(细胞结构、拓扑特征、功能激活或连接)将大脑划分为不同的区域，但最近的一系列研究揭示了融合多种模态可以划定更稳定的边界。更重要的是，构建参考脑图谱为融合从基因、蛋白质、突触和神经元到区域、通路和整个大脑的大规模信息奠定了基础，也为通过数据融合技术全面探索神经科学在健康发展和临床病理方面的应用提供了可能。此外，多模态融合方法也被应用于探索认知和发育的奥秘，以及挖掘精神疾病的早期诊断、亚型分类和预后预测的生物标记。在最近的研究中，相较于单一模态，融合多模态的研究在上述科学问题中均更有优势，不仅能挖掘到更多单模态无法看到的变化，且基于多模态特征开展的分类和个体化预测的精度更佳。
图1 本综述涉及四个相互关联的主题
如图 1 所示，本综述涉及四个相互关联的主题 : 1) 方法论：总结了近年来具有代表性的多模态脑成像融合技术；2) 多模态脑成像绘制脑图谱，回顾了基于解剖结构、功能激活、连接性或多种模态信息的宏观和微观层面的脑图谱构建范式；3) 多模态融合在认知和发育研究中的应用：包括多模态融合方法如何帮助提高对行为表型和脑衰老的预测和理解的代表性应用；4) 多模态融合在脑疾病中的应用：阐述多模态融合如何帮助加速探索脑疾病的潜在生物学机制。
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Multimodal Fusion of Brain Imaging Data: Methods and applications
Na Luo, Weiyang Shi, Zhengyi Yang, Ming Song & Tianzi Jiang
https://link.springer.com/article/10.1007/s11633-023-1442-8
https://www.mi-research.net/en/article/doi/10.1007/s11633-023-1442-8
BibTex:
@Article {MIR-2022-12-391,
author={ Na Luo, Weiyang Shi, Zhengyi Yang, Ming Song, Tianzi Jiang },
journal={Machine Intelligence Research},
title={Multimodal Fusion of Brain Imaging Data: Methods and Applications},
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pages={136-152},
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