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FOXO1转录因子影响CAR-T疗效的生物学效应

已有 522 次阅读 2024-4-13 22:05 |个人分类:肿瘤治疗|系统分类:科研笔记

CAR-T疗法的一个主要局限是这些T细胞在体内的持久性较差,维持存活和肿瘤杀伤力的时间不长,尤其是在实体瘤中的疗效有限。已有的研究认为T细胞的记忆基因的表达,与CAR-T细胞在患者体内的长期存活和临床疗效有关,这提示T细胞的记忆程序可能是CAR-T细胞在体内持久功能的基础。最近的一项研究显示转录因子FOXO1是参与CAR-T细胞的免疫记忆和抑制T细胞耗竭的关键调控因子。

FOXO1(Forkhead Box O1)是一种转录因子,在调控细胞的存活、增殖、分化等过程中起着重要的作用。在CAR-T细胞中,发现FOXO1是促进T细胞记忆功能和抑制耗竭状态的关键因子之一。采用药物抑制或基因编辑内源性FOXO1会减少记忆相关基因的表达,促进T细胞耗竭(exhaustion)样表型的形成,进而损害CAR-T细胞的抗肿瘤活性。相反,过度表达FOXO1会诱导启动与T细胞记忆相关的基因表达程序,FOXO1的结合位点可以更容易地结合到染色质上的特定区域,从而影响基因的表达和细胞功能。

有关转录因子FOXO1研究的另一篇论文发表于同期“Nature”杂志上,从T细胞的“干细胞性”(stem-like)的角度,探索了FOXO1表达对CAR-T等过继性T细胞疗法的重要意义。作者认为,在实体瘤微环境中,CAR-T细胞因长时间的抗原刺激、代谢竞争和缺乏适当的共刺激信号而发生终末分化。终末分化的CAR-T细胞与耗竭的内源性T细胞类似,由于功能障碍、免疫效应功能减弱和存活持久性下降,而无法消灭肿瘤。这类T细胞的特点是效应分子表达减少,免疫检查点分子(PD-1、LAG3和TIM3等)以及与耗竭相关的转录调节因子等表达的增加(如:IRF49,Interferon Regulatory Factor 49一种调节T细胞功能和免疫反应的转录因子,参与调控T细胞分化、增殖和活化,影响免疫应答,在耗竭状态下,IRF49表达可能增加,导致T细胞功能受到抑制)。上述特点表明这些细胞处于一种耗竭状态,功能不如正常情况下的T细胞。

表型为CD45RA+CD62L+的低分化CAR-T细胞能持续存活更长时间,这是因为分化程度较低的T细胞能保持较高的多潜能性和较强的自我更新能力,也就是这些T细胞保持了更多的“干性”(stemness),能产生更多的效应细胞后代,而改善对肿瘤控制。因此,在培养扩增CAR-T,亦或TILs时,初始频率有较高低分化T细胞,可能有助于提高存活持久性和治疗潜力。

理论上而言,T细胞的分化、代谢和表观遗传学重编程(epigenetic reprogramming)等有关过程是相互依存的。T细胞耗竭的特点是效应功能下降,表观遗传调控参与这些过程,比如在关键基因位点上可能会出现DNA甲基化的各种改变,导致T细胞耗竭,影响对抗病原体和对肿瘤细胞的杀伤能力。T细胞衰竭的主要特点是效应功能未达到最佳状态,这些功能即由表观遗传调控,也直接受到细胞内代谢物的控制。就CAR-T,亦或TILs细胞而言,氧化代谢的改善和线粒体生成的增加都有利于T细胞持久性存活和对肿瘤细胞杀伤功能的改善。

目前已探索出多种方法来调节CAR-T细胞分化。这些方法包括使用平衡细胞因子(homeostatic cytokine:是一类维持免疫系统平衡和稳定的细胞因子,例如IL-7和IL-15等,在细胞间相互作用中发挥调节作用,帮助维持免疫系统的稳定状态和免疫系统的功能)、表观遗传调控,以及最近证明的转录调控因子FOXO1的过度表达等。本项研究表明,在CAR-T细胞中过表达野生型 FOXO1,能改善T细胞新陈代谢能力,增强对实体瘤的控制。

与IL-15刺激上调的其他重要的转录调节因子相比(如:TCF1和ID3),FOXO1过表达能在更大程度上保持CAR-T细胞的 "干性 ",并增强其持久性存活的能力。FOXO1的过表达可以帮助CAR-T细胞维持长期的疗效,并且能在抗原刺激下表现出强大的应答反应。这意味着FOXO1在保持CAR-T细胞的持久性方面起着关键作用的同时,并不影响其对抗原刺激的反应能力,这对于提高CAR-T的临床疗效具有重要意义。

本项研究者认为,FOXO1过表达能促进CAR-T细胞的干细胞样表型,维持线粒体功能的良好状态,使之能有效地产生能量并维持细胞的正常代谢活动,这些都有助于CAR-T细胞的持久性和在实体瘤中的疗效。认为通过基因工程建立FOXO1高表达的CAR-T或TILs的策略和方法,能为细胞免疫治疗的临床应用建立有前景的实验基础。

     上述两项研究从维持T细胞的记忆和维持T细胞“干性”的两个不同的角度,均显示了FOXO1转录因子高表达对有效T细胞疗法的重要作用。表明FOXO1很可能是有前景,有潜力,能够增强T细胞疗法的生物分子。一些二代TILs的优化管线,也包括了朝着这两个方向的努力。希望将来的深入工作,能进一步确认现有的证据。此外,动物实验的数据与人体的状态是否一致?仍然需要更多的工作加以证实。希望FOXO1能够成为可用于临床T细胞治疗的重要的转录因子。 

1.      FOXO1 is a master regulator of memory programming in CAR T cells.  Nature. April 2024.      2.  FOXO1 enhances CAR T cell stemness, metabolic fitness and efficacy.  Nature. April 2024

 



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