python httpx 异步爬虫 2021-09-04

小麦多组学网站geneHub页面需要加一个外链，但外链地址与基因id有关。所以要首先拿到外链地址与基因id的对应关系。因此，需要写一个爬虫来获得这个信息。 ...

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翻译|三代测序在群体水平上的研究进展 2021-07-03

对一个或多个物种的多个个体进行测序的目的是在种群水平上识别遗传变异，进一步解决进化、农业和医学等研究领域的问题。以往的包括全基因组关联研究等在内 ...

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翻译：植物泛基因组综述（Plant pan-genomes are the new reference） 2021-06-22

泛基因组肯定是未来之趋势，虽然不是每个人都能整整泛基因组，但整整某类基因或基因家族是否可以呢？比如，单参考基因组时代，不同物种中，都发了N多基因 ...

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GATK流程不用再分割小麦染色体 part2 2021-06-11

鉴于上次发表的" GATK流程不用再分割小麦染色体 "，有些内容说的不是很清楚, 且科学网博客发表之后无法更改，遂再次更新一次。 对小麦来说，染色体较大 ...

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NCBI上传fastq.gz以及bam文件有文件大小限制 2021-06-10

NCBI上传fastq.gz以及bam文件有文件大小限制。 fastq.gz不能超过200G，bam不能超过500G。

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bwa samtools 衔接时的一些注意事项 2021-06-09

每台服务器都有自己的脾气，硬件上CPU和内存不同，软件上系统环境不一样。 长时间使用一台服务器或电脑，写好的很多流程，软件参数几乎都是固定的，而且都 ...

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基因注释小结 2021-03-05

基因注释一般是指采用生物信息学的方法获得已组装好的基因组中基因的位置、结构等信息，一般包括从头注释、同源注释和基于转录组和蛋白质组的注释。基于转录组 ...

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