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最近读文献的一些体会
精选
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研一只上课，偶尔参加组会，感觉时间挺充裕的。想来想去，读文献是对自己和老板最负责任的做法。
源头在哪里？
刚开始不能着急，找到源头就找到了方向。考研的时候就收集了实验室的文章，但是看来看去半年多也没有多少头绪，心里也很着急，越着急越没有进度。后来，几篇文章反复看了好多遍，终于从一篇简报的概述部分找到了研究的“源头”，有了源头，线索就容易理顺了。
利用软件
学着用Endnote，文献积累少的时候，这个软件的优势凸现不出来。但是随着知识面的扩大，信息需求的增大，Endnote会表现出强大的管理和检索的功能，提供个性化的文献数据库管理。自从找到了文献的“源头”，我就开始按照线索建立数据库，比如有些文献经常在我们实验室的文章里出现，那我就要把它归纳到数据库里面去，数量多了，再按照诸如：实验方法、基因组、遗传、生态、分类等等这样的目录把这些文献进行归类。有了这样一个目录，以后无论是新文献归类还是寻找特定方向的文献就都非常方便了。不过这种分类要与时俱进，经常调整才能满足需要。Endnote给每一篇文章提供了各种信息选项，其中可以对文献进行标记，以前的老板建议我们给每一篇文章加重要性标记，如IM（important），VIM（very important）等等吧。
其实建立文献数据库是一个很麻烦、工作量也很大的工作，虽然有参考文献的指导，毕竟从浩如烟海的期刊里面找到自己需要的信息本身就是个技术活。我经常就烦了。所以我不会一次就把它建好，就是顺手做一下：比如挂在网上看电影的时候。
后来我用Endnote写了一篇读书报告，与其说是读书报告，不如说它是一篇英文材料的翻译。但是，我很严肃地按照以前老板教的方法去写，没有把握的地方就红色标记，留待以后查阅解决。读书笔记可以一直补充下去，遇到有用的信息都总结在里面备查。对以后做研究很有帮助。
我把报告发给老板，他强调了归纳：总结新规律，提出新问题。我觉得这是一个很高的要求。因为现在文献读的还是有限，每每想到什么点子，高兴了没有几天，就发现别人已经写过了，又为此沮丧一阵。反复几次，我找了一种自以为效率比较高的办法——软件。我在生命科学实验中心论坛上下载了一些文献管理软件，Quosa、RefViZ还有HistCite，最近还听说了CiteSpace不过没用过。我用HistCite去寻找我们这个方向的发展线索，如果分析结果和实际情况一致，那么我就按图索骥，分门别类的去读，效率高得多。
但是，现在我想提醒自己，软件是我的工具，不要做它的奴隶。乐此不疲的搞一堆软件，即使分析结果再漂亮，自己不用也白搭。而且，软件有它自己的局限性，要想利用好它，还是要靠以前读文献积累的经验和思考。
读书报告
按照以前实验室的习惯，读书报告分为两种：精读报告和泛读笔记。精读报告写起来很累的，我觉得这个也不能够着急。第一步是先看好摘要，这是一篇文章的眼睛。摘要这个东西是很有讲究的。比如一些杂志的文献摘要，行文风格、句式等等吧都是非常固定的，像BMC Genomics这样的还有固定格式，把摘要分了三段：Background,Results和Conclusion。第二步是通读文献，知道这个组用了什么方法作了什么样的工作，主要意义在什么地方，就可以了。第三步要分块，看看这个文章用了什么思路，对自己有什么启发；这个文章用了什么方法，仪器、试剂、控制条件等等。实验方法我一开始不注意的，但是后来我发现这东西也很有讲究，同样一个菌株、在不同的文献里头培养温度是不同的，我后来发现这是因为人家研究目的不一样。还有甘油的浓度，数字后面v/v和v/w意义也不同的。虽然这些细节对研究思路没有直接的帮助，但是养成阅读的好习惯，以后自己做实验也可以少走弯路。然后，这些东西都要体现成读书笔记，只有落实到纸面上或者文档里面，这个精读才算是完成了。而且以后遇到相似相关的工作还要随时拿出来比较归纳。我原来的老板要求研究生每月一篇精读报告，我读研以后，还异想天开过每周一篇，但是实际操作起来非常困难。因为，想要看好一篇文献，从选文献、到看文献再到完成读书报告，是一个非常严谨漫长的过程，其中要解决的问题也很琐碎，一月一篇都不容易呢。
综述、简报和快报
上面一段是我看研究报告的体会，至于文献综述，和这个不大一样的。我觉得文献综述要像小说一样来读。至少读出这个领域的来龙去脉、前因后果。再进一步归纳出将来的热点，或者说弄明白作者展望的内容。对了，我觉得相对于内容，文献综述最大的用处在于他提供了本领域有价值的工作，我后来找到很多文章都是从综述后面的参考文献中找到的，很有效率。
还有一些是简报呀、评论呀什么的，我感觉非常短平快，效率很高。就那么一读，就可以受到很多启发。起码让我知道现在大家在关注些什么。这个一般还是要看些比较牛的杂志的letters或者essays。至于什么是比较牛的杂志，这个要因学科而异，不能迷信。另外，听说很多著名的学者都喜欢写快报。
其它牢骚
文献要慢慢读，读多了就会累。我还是习惯看纸版的东西，做笔记也喜欢写在纸上，而不是对着电脑一边看PDF，一般在Word里面抄抄写写。开着电脑，必定就要连上网线，那么QQ，校内，邮件，BBS没完了。这个还是要看自制力，以及最好不带电脑，就拿着纸版的文献在教室里看，带着字典勤翻阅就好了，遇到字典和专业字典都没有的，就只好在网上查了。
对了，说到字典，一定要预备一本专业词典，虽然说基本上在线翻译都能提供解答，但是很多都不规范，还是专业的词典比较好，还能给出详细的解释。词典挑选也很有学问，我到现在也没有找到一本非常理想的，基本上要几个词典一起用才勉强满足需求。
我还记得我在大学里正经看的第一篇文献是一篇综述，30多页，我看了俩月才看完。语法倒是不难，可是里面的词汇涉及分类学、生态学等等，我常常查过一遍，后面就又忘了。可是，咬牙坚持看完了这一篇，我的阅读能力较之以往有了质的飞跃。所以，我觉得读文献也是一个磨练心智的过程，让自己的心沉下来、沉下来，心态下来了，学问也自然就上去了。
牢骚了这么多，文献还是要继续看，报告还是要继续写，耐心，一定要有耐心，才能看到自己一点点进步。
PS：这一堆字是我在校内写的日志改编的结果；文中提到的生命科学实验中心论坛是中国科技大学的，文献板块的罗老师非常热心，提供了很多软件和用法，有兴趣的老师和同学，请到这个网址浏览：http://biotech.ustc.edu.cn/forum/
https://blog.sciencenet.cn/blog-285168-290390.html
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