周苑分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yaoqizhou 论春语秋,谈科说学,声传言教。


  • 深圳湾实验室,研究员

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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强买强卖的中国移动 2022-08-27
中国移动 有近10亿客户,是中国 最大的 通信服务供应商,据说是盈利能力领先、市值排名位居前列的世界级电信运营商。现在我有点明白盈利能力领先是怎么来的了。 ...
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痛并快乐着:蛋白质结构预测的边角故事 2022-07-20
导读 :2020年底,AlphaFold2在蛋白质结构预测的CASP比赛中实现了高精度预测,使得一个平时默默无闻的小众学科变成了家喻户晓的明星。 AlphaFold的成功 ...
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抛弃“影响”因子,计算颠覆因子! 2022-07-03
导读 :全世界科技界受“影响”因子的毒害久矣:追热门、跟风向、造新闻、编故事。已经有科学家开发、验证的颠覆因子,却不被以盈利为目标的公司使用!呼吁 ...
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怎样推动“从0到1”的原始创新?从基于AI神经网络的蛋白质从头设计说起 2022-06-21
导读 :现在全国上下都在提倡推动“从0到1”的原始创新,提升基础研究的水平,但是到底什么是“从0到1”,什么是“从1到N”?见仁见智,并没有什么很 ...
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我永远的神 2022-03-07
我太太是山东人。我认识的山东人,除了爱喝酒,就是喜欢吃面食了,特别是饺子,可以说是面食之王了。我太太也从小就特别喜欢吃饺子,常常因吃撑了而胃疼。后来 ...
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切蛋白质分子,用牛刀能切出什么? 2022-02-08
导读: 俗话说杀鸡不用牛刀。假如用了牛刀,无论从哪里下刀,即一刀两断,这两块也无法自我组合满血复活,除非在恐怖片里;但是如果有医生在场紧急缝合,也 ...
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回国半年的感悟 2021-09-21
年年中秋,今又中秋,今年月儿分外圆。今年中秋是我出国36年后第一个在国内度过的中秋节日。全职回国工作半年 , 得到了众多旧雨新知的关怀,感谢朋友们的帮助 ...
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中澳两国人才迁居的比较:目前人才政策还缺什么? 2021-09-07
八年前,我被澳大利亚格里菲斯大学作为正教授引进,从美国移居到澳大利亚。今年三月我作为资深研究员全职加入深圳湾实验室,回到国内。在这里,我试着比较一下 ...
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拜托,AI还没有在RNA结构预测上获得重大进展! 2021-08-28
昨天,几个科普公众号轰炸了朋友圈,下面是几个例子: “Science封面重磅:新型AI算法准确预测RNA三维结构 ” — 学术头条; “继AlphaFold之后又一结构 ...
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七夕到,鹊桥今何在? 2021-08-15
昨天是七夕,中国的情人节,却没有感觉到情人节的味道。在国外,情人节会有铺天盖地的广告,商店一般提前几个星期就张灯结彩,就怕这个节日被人遗忘了。我昨天 ...
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cjj1234 2021-9-10 22:58
周老师您好,我是华侨大学的一名学生,我最近再看您的这篇文章 RNA secondary structure prediction using an ensemble of two-dimensional deep neural networks and transfer learning ,尝试运行了 SPOT-RNA,生成的RNA结构预测图,有些碱基对的连线是绿色的,我不太清除这个绿色的连线是怎么来的,怎么通过用VARNA的命令行画出来的呢 ,特意来请教您。 我在utils.py 这个文件中看到了 用VARNA生成结构图的代码 subprocess.Popen( , stderr=subprocess.STDOUT, stdout=subprocess.PIPE).communicate() 里面这那个tertiary_b ... ...
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