关于人类基因组的一些说明 2020-04-21

GRC 人类基因组计划之初，曾试图勾勒出一套完整的、一致性的基因组序列图谱，但无论是测序技术、组装算法还是基因组本身的多样性问题，都让这套“纯粹的”参考 ...

(3872)次阅读|(0)个评论

宏基因组常用分析流程简介 2020-04-14

比对鉴定，拼接组装，功能分析 我们简要介绍两个常用的宏基因组数据分析工具包。 bioBakery workflows bioBakery来自于 The Huttenhower Lab ，开发者们提 ...

(8005)次阅读|(0)个评论

宏基因组分析方法初探 2020-04-02

探究微生物组，解构身边熟悉的陌生环境 随着测序通量越来越高，价格成本越来越低，痕量微生物也难逃深度测序的挖掘。在高通量测序技术的辅助下，宏基因组学 ...

(2967)次阅读|(0)个评论

搭建基于Docker的Tensorflow+Cuda环境 2020-03-23

机器学习已是大数据分析的必备手段，我们尝试在Linux（Ubuntu 18.04）下搭建一个基于Docker的Tensorflow+Cuda环境，以用于学习、试验等。 关于Docker的安装和 ...

(3449)次阅读|(0)个评论

Kaggle之路：Titanic 2018-12-28

Overview Titanic可谓是Kaggler的必经之路。我们以其为例，走一个完整的机器学习分析流程。 Step 1: 问题分析 关于Titanic的相关描述可参考官网，这是一个二 ...

(2932)次阅读|(0)个评论

Feature Importance 2018-12-28

当我们训练完一个模型，得到理想的预测结果之后，或许我们还应该问问：哪个特征最为重要，它对模型有什么样的贡献？ Permutation Importance Permutation的策 ...

(6230)次阅读|(0)个评论

生物信息分析流程（2） WDL入门 2018-10-29

  The Workflow Description Language (WDL) makes it straightforward to define analysis tasks, chain them together in workflows, and parallelize ...

(6902)次阅读|(0)个评论

生物信息分析流程（1） docker入门 2018-10-11

  Build, Manage and Secure Your Apps Anywhere. Your Way. 流程化是工业进步的标志，生物学科尚处于基因组学大发现时代，面临着庞杂数据的处理，相 ...

(6134)次阅读|(0)个评论

查看更多